大规模RNA阵列验证水稻茎组织特异性高表达基因.pdfVIP

农业生物技术学报 Journal of Agricultural Biotechnology 2004,12 (4) : 357~362 ·研究论文· 大规模RNA 阵列验证水稻茎组织特异性高表达基因* 1 1 2 1 2 1 凤池 董海涛 ** 谭学林 王 晟 徐绍忠 李德葆 ** ( 1.浙江大学农业与生物技术学院，杭州310029 ；2.云南农业大学稻作研究所，昆明65020 1) ： ，发现一些在茎 摘要 在前期大规模水稻( )EST 测序和生物信息学分析的工作中 cDNA 文库中高水 表达 因，包括叶绿素a/b 结合蛋白 （ ）、富脯氨酸蛋白 （ ）、脱落酸和逆境诱导蛋白 （ ）、微管蛋白 （ ）等基因。为验证这些基因是否为茎特异性表达基因，选择高冗余度的EST 克隆制备cDNA 探针，与高通量的RNA 阵列进行杂交。结果表明：叶绿素a/b 结合蛋白基因在叶中高丰度表达且受光诱导，是一个光合作用相关 因，而不是茎特异性 微管 ；脱落酸和逆境 基因； 蛋白基因在茎和根中都具有较高的表达丰度，说明根的纤维化和茎的木质化是同一生化过程 诱导蛋 白基因虽然在茎中高表达，但其丰度容易受环境条件（如营养缺乏、逆境等）的影响，而不是在茎中以组成型方式稳定表达，不 ，也 能被称为茎特异性表达基因。这些结果提示出在一个EST 数据库中高冗余度的基因并不能完全代表该文库的特征 不能单 纯通过EST 分析技术认定它们是组织特异性表达基因，需要进一步的确认。通过在不同发育阶段、不同生理状态及不同逆境状 态下获得全局性的表达谱特征，才能较客观地评价一个基因是否为组织特异性表达基因。 关键词：阵列；水稻；茎； 因表达谱 Identification of Rice ( L.) Stem Specific Genes Using Large-scale RNA Array Technology 1 1 2 1 2 1 YU Feng-Chi DONG Hai-Tao ** TAN Xue-Lin WANG Sheng XU Shao-Zhong LI De-