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相关生物信息学分析及软件的使用 实验目的 了解相关的生物信息学数据库（NCBI数据库等）和掌握数据库检索方法，学会相关软件的使用，并利用生物信息学软件根据研究目的和对象设计引物。 方法 根据酶或基因的名称（GenBank登录号）找到需要的基因的核苷酸序列，根据序列和PCR的目的设计获得该基因的CDS的引物(注意引物设计时引物酶切位点)。 主要数据库介绍 Genebank Genebank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列，以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。 NCBI的网址是： EMBL核酸序列数据库由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成，查询检索可以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。 数据库网址是：http://www.ebi.ac.uk/embl/ DDBJ数据库日本DNA数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库，与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。 DDBJ的网址是：http://www.ddbj.nig.ac.jp/ NCBI介绍：NCBI建立在1988年,作为一种公共分子生物学信息资源, 而创建的公开数据库。 NCBI的计划：1.基本研究；2.数据库；3.软件的开发；4.教育和训练 现在我们以查找甘薯异戊烯氯喹异构酶（Ipomoea batatas isopentenyl diphosphate isomerase ，ipi）的 编码序列为例，介绍如何从ＮＣＢＩ中在线获取所需要的核酸序列． 　　aagcaagacg ccaagggcca aggctggctg caagaagcaa agaggaacga acactgtgaa 61 tatcccaatg tcgatgatgg cttctgttca aatctgtcgg agattctctc ccctagtcgc 121 ccggccggcg atttactctg ccaattcttc attcctctca ccagtctctt tcgcctcttc 181 ttctctttca attatgccga tccgcctccg ctgcagagct tcagtacact ctgtccgcgc 241 cgcctccacc atgggggaca ccatcactga tgccaacatg gatgctgtcc agcgccgcct 301 catgtttgac gacgagtgta ttttggtgga tgagaatgac cgtgttgttg gtcatgatac 361 caagtataat tgtcatctta tggagaagat tgaatctgag aatctgcttc acagagcttt 421 cagtgttttc ttatttaatt caaactatga gttgcttctt cagcaacgat ctgcgacaaa 481 ggtcaccttc cctttggtgt ggactaacac ctgctgcagc catcctctgt accgggagtc 541 tgagttgatt gaagagaatg ctcttggtgt gaggaatgct gcacaaagaa agcttcttga 601 tgaactgggg attcctgcag aggatgtccc agttgatgaa ttcacaacat tgggccgtat 661 cctgtataaa gcaccttctg atgggagatg gggagagcat gaacttgatt atcttctctt 721 cattgtgagg gatgttggca tgcacccaaa cccggatgag gttgcagatg ttaaatatgt 781 gaatagggaa cagctgaaag agatcttgag gaaagcaaat gctggagagg atggtataaa 841 gctttcccct tggttcagat tagtcgtcga aaatttcttg ttcaaatggt gggatcatgt 901 cgagaaaggc accctaatgg aagctgcaga tatgaaaacc attcacaagt tggcctaaac 961 agccattggc tgagcttttg ttaaaccctt acatctacca ttcacttaac tgagcaaaaa 1021 tatattctat ggtcttctgc ttagtttcat gcttcatgct tgaactttca agttttatgt 1081 tacttttggc tgttaggaac tagtaatata tgtg