12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2010年，第30卷，第3期，第 379—384页 GenomicsandAppliedBiology，2010，Vo1．30，No_3，379—384 数据分析 AnAnalysis 12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析 崔亚茹 张坤 山z 罗玉萍 李思光 1南昌大学生命科学与食品工程学院，南昌，330031；2同济大学医学院，上海，200092 通讯作者，siguangli@163．com 摘 要 很多microRNAfmiRNA)基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇。miRNA基因簇在进化上 较为保守，有其特殊的生物学意义。miR一302基因簇在胚胎干细胞中特异表达，对胚胎干细胞的自我更新和 多潜能维持有重要的作用。本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物 种的miR-302基因簇。生物信息学分析表明，这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子 区，但转录方向与LARP7基因转录方向相反。序列相似性分析显示，同一物种miR一302簇成员间以及不同 物种相应miR-302簇成员间相似性均较高。进化分析表明，基因复制可能是miR一302基因簇进化的主要 驱动力。 关键词 基因簇，miR一302，分子进化 BioinformaticsAnal