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基于BP神经网络的DNA解链温度预测模型.pdf
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基于BP神经网络的DNA解链温度预测模型
刘文斌,·:朱翔鸥1刘向荣2
1(温州大学计算机科学与工程学院,温州325027)
2(华中科技大学控制科学与工程系,武汉430074)
E—mail:wbliu@mail.hust.edu.en
摘 要 在DNA计算中,为了确保计算过程的可靠性,要求编码信息的DNA序列必须具有相似的热力学稳定性。解链
温度是目前评价DNA序列热力学稳定性的一个主要的参数,目前,生物工程中常用的各种预测方法都存在某些序列的
误差偏大的缺点.因此难以满足像DNA计算这种大量DNA序列进行各种生化反应的计算过程的要求。论文以DNA序
列的邻近法参数为基础,建立了一个基于BP神经网络的解链温度的预测模型。计算结果表明,DNA序列的解链温度的
误差可以达到±5.5℃的范围。
关键词邻近法模型 解链温度神经网络DNA计算
文献标识码A 中图分类号TPl83
文章编号1002—8331一(2006)10—0001一04
ofDNA
Duplex
PredictingMeltingTemperature
byBPNeuralNetwork
LiuWenbinl·2Zhu Liu
XiangoulXiangron92
and
of Science University,Wenzhou325027)
1(CollegeComputer Engineering,Wenzhou
ofControlScienceand of
University
2(Department Engineering,Huazhong
430074)
ScienceTechnology,Wuhan
ther-
DNA ofthe DNA is that should similar
Abstract:In encodingsequencesthey keep
computing,onerequirement
inordertomaintainthe ofthe is asuitable
process.Melting pa—
modynamicstability reliabilitycomputing temperature
rameterusedtoevaluatethe ofDNA traditional methodsusedinbio—
thermodynamicstability sequences.As predicti
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