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基于BP神经网络的DNA解链温度预测模型.pdf

掣姑船业业糇 掌·博士论坛·睾 凑习睁带带芥赤 基于BP神经网络的DNA解链温度预测模型 刘文斌,·:朱翔鸥1刘向荣2 1(温州大学计算机科学与工程学院,温州325027) 2(华中科技大学控制科学与工程系,武汉430074) E—mail:wbliu@mail.hust.edu.en 摘 要 在DNA计算中,为了确保计算过程的可靠性,要求编码信息的DNA序列必须具有相似的热力学稳定性。解链 温度是目前评价DNA序列热力学稳定性的一个主要的参数,目前,生物工程中常用的各种预测方法都存在某些序列的 误差偏大的缺点.因此难以满足像DNA计算这种大量DNA序列进行各种生化反应的计算过程的要求。论文以DNA序 列的邻近法参数为基础,建立了一个基于BP神经网络的解链温度的预测模型。计算结果表明,DNA序列的解链温度的 误差可以达到±5.5℃的范围。 关键词邻近法模型 解链温度神经网络DNA计算 文献标识码A 中图分类号TPl83 文章编号1002—8331一(2006)10—0001一04 ofDNA Duplex PredictingMeltingTemperature byBPNeuralNetwork LiuWenbinl·2Zhu Liu XiangoulXiangron92 and of Science University,Wenzhou325027) 1(CollegeComputer Engineering,Wenzhou ofControlScienceand of University 2(Department Engineering,Huazhong 430074) ScienceTechnology,Wuhan ther- DNA ofthe DNA is that should similar Abstract:In encodingsequencesthey keep computing,onerequirement inordertomaintainthe ofthe is asuitable process.Melting pa— modynamicstability reliabilitycomputing temperature rameterusedtoevaluatethe ofDNA traditional methodsusedinbio— thermodynamicstability sequences.As predicti

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