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RNA酶活性的控制

中国试剂网 3.9.75 RNA 酶活性的控制 为了获得高质量的真核细胞 mRNA , 必须使用 RNA 酶的抑制剂或采用下述的 破碎细胞和灭活 RNA 酶同步进行的方法,最大限度地降低细胞破碎过程中所释 放的 RNA 酶的活性。同时,避免偶然引入实验室内其他潜在的痕量 RNA 酶也 很重要。下面列举避免RNA 酶法染问题的一些注意事项。大多数有经验的研究 者并不拘泥于这些注意事项,只是在遇到问题时可能采用其中的一种或几种方法 加以解决。 实验程序 RNA 酶的抑制剂 破碎细胞和灭活 RNA 酶同步进行的方法 (一)实验程序 如不谨慎操作,外源性RNA 酶可以通过下述途径污染 RNA 制品: (1)玻璃制品、塑料制品和电泳槽 灭菌的一次性使用的塑料制品基本上无 RNA 酶,可以不经预处理直接用于制备和贮存 RNA 。实验室用的普通玻璃器皿 和塑料制品经常有RNA 酶法染,使用前必须于 180 ℃干烤 8小时或更长时间(玻 璃器皿)或用氯仿冲洗(塑料制品)。另一种方法是用 0.1 %焦碳酸二乙酯(DEPC ) 的水溶液浸泡用于制备RNA 的烧杯,试管和其他用品。DEPC 是 RNA 酶的强烈 抑制剂,但其作用并不是绝对的 (Fedorcsak 和 Ehrenberg,19 )。灌满 DEPC 的 玻璃或塑料器皿在 37℃放置 2小时,然后用灭菌水淋洗数次, 并于 100℃干烤 15 分钟 (Kumar 和 Lindberg,1972) 。在 15 lbf/in2(1.034x105Pa)高压蒸氯灭菌 15 分钟。上述处理可以除去器甲上痕量的DEPC ,以防DEPC 通过羧甲基化作用对 RNA 的嘌呤碱基进行修饰。 羧甲基化的 RNA 在无细胞体系中翻译效率很低,然而,除非其中大部分嘌 呤碱基均被修饰,否则其形成 DNA :RNA 或 RNA :RNA 杂交休的能力并不明 显降低。用于RNA 电泳的电泳槽应用去污剂洗干净,再用水冲洗,用乙醇干燥, 然后灌满 3 %的H2O2 溶液,于室温放置 10 分钟,然后用 0.1 %DEPC 处理过的 水彻底冲洗电泳槽。最好能留出一些玻璃器皿、塑料制品和电泳槽作上特殊标记, 存放在指定地点,为RNA 实验专用。 (2)研究人员造成的污染 RNA 酶最主要的潜在污染源是研究人员的手。因此, 中国试剂网 3.9.75 在准备分离的和分析 RNA 的材料和溶液时,主有涉及RNA 的一切操作过程中, 都应戴一次性手套,接触“胖的”玻璃器皿和其他物品以后,手套就可能沾染上 RNA 酶,因此进行 RNA 实验时应勤换手套。 (3)污染的溶液 用高压灭菌的水和 RNA 研究专用的化学试剂配制溶液,用 干烤过的药匙称取试剂,将溶液装入无RNA 酶的玻璃器皿。可能的话溶液均应 用 0.1 %DEPC 于 37 ℃至少处理 12 小时,然后于 100℃加热 15 分钟或在 15lbf/in2(1.034x105Pa)的高压下蒸气灭菌 15 分钟。注:DEPC 可与胺类迅速发生 化学反应,因些不能用来处理含有 Tris 一类的缓冲液。可存几瓶新的未开封的 Tris 晶体以制备无RNA 酶的溶液。 (二)RNA 酶的抑制剂 下面介绍 3种广泛应用的特异性RNA 酶抑制剂。 (1)RNA 酶的蛋白质抑制剂是 从人胎盘分离的一种蛋白质可与多种 RNA 酶 紧密结合 (KI≈3x1010 )形成非共价结合的等摩尔复合物,使 RNA 酶失活。此 蛋白质体内可能是血管生成素的抑制剂,血管生成素是氨基酸序列和推测的三级 结构与胰 RNA 酶类似的一种血管生成因子, 几个厂家以不同的商品名出售这 种抑制剂,该蛋白质应置于含 5mmol/L 二硫苏糖醇 (DTT )的 50 %甘油中,贮 存于-20 ℃。抑制剂制品冻融数次后或放置在氧化条件下即应弃之不用,因为上 述处理会使蛋白质变性从而释放出所结合的 RNA 酶。因此,在使用变性剂裂解 哺乳动物细胞这一提取 RNA 的初始步聚中不应使用这种蛋白抑制剂。然而职用

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