ncbi简介.pptVIP

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  • 2015-09-16 发布于广东
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MMDB MMDB的记录以ASN.1格式存储,可以用Cn3D, Rasmol, 或 Kinemage来显示。另外,数据库中类似的结构已经被用VAST确认,新的结构可以用VASTsearch来同数据库进行比较。 ? Cn3D “See in 3-D”, 一个用于NCBI数据库的结构和序列相似显示工具,它允许观察3-D结构和序列—结构或结构—结构同源比较。Cn3D用起来就象你浏览器上的一个帮助工具。 ? VAST 矢量同源比较搜索工具 一个在NCBI开发的计算算法,用于确定相似的蛋白三维结构。每一个结构的“结构邻居”都是预先计算好的,而且可以通过MMDB的结构概要页面的链接访问。这些邻居可以用来确认那些不能被序列比较识别的远的同源性。 ?VAST 搜索 — 结构—结构相似搜索服务。比较一个新解出的蛋白结构和在MMDB/PDB数据库中的结构的三维坐标。VAST搜索计算一系列可能会被交互浏览的结构邻居,用分子图形来观察重叠和同源相似。 ? 分类学 NCBI的分类数据库主页 — 关于分类计划的一般信息,包括分类资源和同NCBI分类学家合作的外部管理者的列表。 ?分类浏览器 — 搜索NCBI的分类数据库,包括大于70000个物种的名字和种系,这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。可以检索一个特定种或者更高分类(如属,科)的核酸,蛋白,和结构记录。如果有新物种的序

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