白菜与甘蓝基因组转座子表达及其对基因调控的潜在影响_赵美霞.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2013 8 , 35(8): 1014 ―1022 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2013.01014 白菜和甘蓝基因组转座子表达及其对基因调控的潜在 影响 1,2 2 1 2 赵美霞 , 张彪 , 刘胜毅 , 马渐新 1. , , 430062; 2. , 47907 转座子或转座元件是大多数真核生物基因组的主要组成成分。甘蓝(Brassica oleracea)基因组比白菜 (B. rapa) 大主要是转座子的扩增差异造成的。然而, 这两个芸薹属近缘物种转座子表达水平以及对基因的调控 和功能的影响目前还不清楚。文章对白菜和甘蓝叶、根、茎3 个器官的转录组数据进行了初步分析。结果显示, 转座子的表达量很低, 转录组reads 中有1%来自转座子的转录本; 转座子的