H1N1亚型猪流感病毒广东分离株全基因克隆及其遗传演化分析.pdf

第 24 卷 　第 5 期 病 　　毒 　　学 　　报 Vol . 24 　 No . 5 　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　 2 0 0 8 年 9 月 CH IN ESE J OU RN AL O F V IROL O GY Sep t ember 2008 H1 N1 亚型猪流感病毒广东分离株全基因克隆及其遗传演化分析 1 1 1 1 2 刘大飞 ,刘明 ,刘春国 ,杨涛 ,刘大程 ( 1. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 　兽医生物技术国家重点实验室 　农业部动物流感重点开放实验室 , 黑龙江 　哈尔滨 　15000 1 ; 2 . 莱阳市城厢兽医站 ,山东 　莱阳　265200) 摘要 :为了研究 H 1N 1 亚型 SIV 遗传演化与变异的特性 ,采用 R TPCR 技术分别扩增 A/ Swine/ Guangdong/ L M/ 2004 ( H 1N 1) 的 8 个基因片段 ,分别将其克隆到 p MD 18T 载体 ,进行全基因组序列测定 。核苷酸序列测定结果显 示 :L M 株 SIV 各基因片段均未发现核苷酸插入或缺失现象 。HA 切割位点处的氨基酸序列序列为 IP SIQ SR ↓G , 与高致病性 SIV 的 H 1N 1 亚型毒株的分子特征不符合 。HA 基因含有 6 个潜在的 N糖基化位点 ,4 个在 HA 1 的 第 11 、23 、87 、和 276 位 ,增加 2 个分别在 HA2 的 154 和 2 13 位点 ;N A 基因不仅在 58 、63 、68 、88 和 146 位含有高度 保守的N糖基化位点 ,而且在 44 和 235 位增加 2 个潜在的 N糖基化位点 ,这可能是近期 H 1N 1 亚型 SIV 的一个 ( ) 分子特征 。核苷酸同源性结果 : HA 基因与类人谱系的流感病毒分离株有很高的同源性 99 % ,而其他基因均与古 ( ) 典猪谱系的流感病毒分离株同源性较高 87 %～98 % 。从绘制的各个片段进化树和核苷酸同源性分析结果 ,可以 推测该毒株 HA 基因可能来源于类人谱系的流感病毒 ;而其他基因来源于古典猪谱系的流感病毒 。 关键词 :猪流感病毒 ;R TPCR ;克隆;遗传演化分析 + ( ) 中图分类号 :S852 65 95 ; Q78 　　文献标识码 :A 　　文章编号 :1000872 1 2008 ( ) 　　猪流感病毒 Swine Influenza Viru s , SIV 属正 东地区 SIV 分离株在未来 SIV 变异和流行中的作 粘病毒科 ,流感病毒属 ,A 、B 、C 型的 SIV 都能引起 用值得深入研究 。本研究在对 2004 年分离 自广东 ( )