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Robust Sequence Selection Method Used To Develop the FluChip Diagnostic Microarray for Infl
JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, Aug. 2006, p. 2857–2862 Vol. 44, No. 8
0095-1137/06/$08.00 0 doi:10.1128/JCM.00135-06
Copyright © 2006, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.
Robust Sequence Selection Method Used To Develop the
FluChip Diagnostic Microarray for Influenza Virus
Martin Mehlmann,1 1 1 1 1
† Erica D. Dawson, † Michael B. Townsend, James A. Smagala, Chad L. Moore,
Catherine B. Smith,2 2 1 1,3
Nancy J. Cox, Robert D. Kuchta, * and Kathy L. Rowlen
Department of Chemistry and Biochemistry, The University of Colorado at Boulder, UCB #215, Boulder, Colorado 80309 1
;
Influenza Branch, Centers for Disease Control and Prevention, 1600 Clifton Rd., Atlanta, Georgia 303332;
and InDevR, LLC, 2100 Central Ave., Suite 106, Boulder, Colorado 803013
Received 20 January 2006/Returned for modification 10 April 2006/Accepted 14 May 2006
DNA microarrays have proven to be powerful tools for gene expression analyses and are becoming increas-
ingly attractive for diagnostic applications, e.g., for virus identification and subtyping. The selection of
appropriate sequences for use on a microarray poses a challenge, particularly for highly mutable organisms
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