四种denovo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较.pdfVIP

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2015-09-26 发布于重庆
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四种denovo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较.pdf

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四种denovo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较

蚕学通讯第卷第期　　　３２３　年月　　　　　　　２０１２９　ＮｅｗｓｌｅｔｔｅｒｏｆＳｅｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅ１　　　四种组装软件对ｄｅｎｏｖｏ　柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较＊，，，，刘宗林１２许金山１２周泽扬１２３　　（，；重庆师范大学重庆市动物生物学重点实验室重庆１．４０００４７　，；重庆师范大学活性物质生物技术教育部工程研究中心重庆２．４０００４７　，）西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室重庆３．４００７１６　，摘要柞蚕是一类以柞树叶为食料的经济类吐丝结茧昆虫柞蚕微孢子是寄生在柞蚕体　　　，，。内的一种微孢子虫是柞蚕微粒子病的病原其主要通过食下传染或者母体传染来感染柞蚕目，前在分子水平上对柞蚕微孢子虫的研究还很少本研究通过比较分析四种常见的ｄｅｎｏｖｏ组装软　，，件对柞蚕微孢子虫全基因组的组装结果显示不同的软件组装的结果相差甚远由此表明由于柞蚕基因组本身结构的特殊性及组装软件的针对性，。导致了组装质量的差异性本研究对于今后昆虫微孢子虫基因组的组装软件的选择优化提供了重要的参考。关键词微粒子病柞蚕微孢子虫组装