代谢组学的整合化发展及其新进展.pdfVIP

第 38卷 分析化学 ( FENX I HUAXU E) 　评述与进展 第 7期 　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　 20 10年 7 月 Ch ine se Journal of Analytical Chem istry 1060 ～1068 DO I: 10. 3724 / SP. J. 1096. 2010. 01060 代谢组学的整合化发展及其新进展 1, 2 2 2 2 朱 超 　梁琼麟 　王义明 　罗国安 1 ( ) 2 ( ) 华东理工大学药学院 , 上海 200237 　　　 清华大学化学系 , 北京 100084 摘 　要 　代谢组学迅猛发展 , 自身特点及科研使命决定了其整合化的必然趋势 。近年来 ,代谢组学经历了内 ( ) ( 部整合 包括 :检测技术整合 、多样本整合分析 、数据处理方法整合 以及外部整合 代谢组学与其它组学的整 ) 合分析 。整合化发展增强了代谢组学在其应用领域的科学创新性与说服力 。本文综述了代谢组学的整合 化及其最新研究进展 ,并展望了其应用前景 。 关键词 　代谢组学 ; 整合化发展 ; 评述 1　代谢组学整合化发展的必然性 代谢组学创立初期主要是通过核磁共振技术对尿样进行检测 ,分析其中部分代谢产物的变化 [ 1 ] 。 所用的检测技术和数据分析方法是单一的 ,只能满足代谢组学最初研究的要求 。然而 ,代谢组学并不是 对少数代谢物的分析 ,而是对生物样本中尽量多甚至全部化合物进行检测 ,反映生物体内部的代谢状 况 。代谢组学除了研究某一特定的代谢循环以外 ,还要对相互关联的循环进行考察 ,要求对不同类别的 化合物进行同时检测 。这种全面的检测采用单一分析技术难以达到的。根据化合物的不同性质将适用 的分析技术进行整合 , 以致能够实现多种化合物的同时检测 ,满足代谢组学发展的要求 。相应地 ,数据 处理方法也应得到一定程度的改善与创新 。 代谢组学整体性 、系统性 、动态性的研究特点决定了研究过程中所用到的检测技术 、数据处理方法 都要满足高通量 、大规模的要求 ,要经历从单一化向系统化的过渡 。技术整合是代谢组学发展过程中不 可或缺的内容 ,并可能通过技术 “融合 ”达到技术创新 。从代谢组学的研究策略而言 , “整合 ”是科学家 们探索如何解决分析检测、数据挖掘等问题时提出的可行方向[ 2, 3 ] 。研究结果表明, “整合 ”则成为解决诸 多问题的有效手段 。“整合 ”也确实能够带动技术的发展 ,使相关技术得到 “融合 ”,从而促进新技术的形 成 ,为代谢组学的不断发展提供技术动力 。因此 ,代谢组学的发展要求技术的整合 , 同时技术整合也会进 一步促进代谢组学的发展 ,二者将在一个动态的、相互促进的过程中不断前进 。随着代谢组学的发展 , 有关 In tegrated m etabonom ic s的研究成为热点[ 2 ～10 ] ,这也意味着 “整合化 ”成为代谢组学发展的趋势 。 2　代谢组学整合化发展及应用 2. 1　代谢组学整合化发展概况 ( ) [ 1, 11 ] 代谢组学 M etabolom ic s/M etabonom ic s 发展至今 , 已经成为联合运用多种分析手段 ,全面分析研 究对象 ,系统阐述其生物学意义的, “整合化 ”的代谢组学 。它的发展过程是一个不断整合的过程 ,经历了 内部整合和外部整合 。内部整合就是对代谢组学研究所用到的技术手段的整合 ,研究对象的整合 ,是以实 现代谢组学全面性为目的的整