β-环糊精和雌二醇的分子动力学模拟和MM-PBSA自由能计算.pdfVIP

ofAnhui 安徽农业科学。Journal A一．Sei．2008，36(29)：12557—12559 责任编辑庆摩责任校对傅真治 13l-环糊精和雌二醇的分子动力学模拟和MM·PBSA自由能计算 姚雪霞 (南京农业大学工学院，江苏南京210031) 取向，雌二醇都可以和3-CD形成稳定的包结；通过氢键占有率的分析，发现p·cD的构象发生一定程度的变化。MM—PBSA计算结果表 明，A—up取向包结自由能更低，为优势包结模式。进一步分析各个能量项可得。范德华相互作用能为包结的主要驱动力。 关键词MM—PBSA；分子动力学；B一环糊精；雌二醇 中图分类号0641文献标识码A 文章编号0517—66ll(2008)29—12557—03 Molecular SimulationandMM-PBSAFree Calculafion andEstradiol DyRamics Energy of昏cyclodextrin YA0 of 21003 Engineering，NanjingA鲥cultural 1) Xue-xia(College University，Nanjing，Jiangsu Abstractrnle modebetween estradiol molecular possiblebinding B-cyelodextfin(p—CD)andw∞predictedbyusing mechanics／PoissonBoltzmannsurface area)method．Bothorientationand orientationofestradiolcouldform MM—PBSA(moleeular A—up D-up stable with basedonMD conformationof hadsomeextent the complexesp—CD trajectoryanalysis．The p—cD changebyinvestigatingoeeupa． tionof bondsof resultsMM—PBSA showedthatthebindfree of orientationwas hydrogen B—CD．Thecomputedby technique energyA—up lower thanthatof orientation to further orientation，therefore each could D—up A·up belongedpreferentialbindingmode．By analyzingenergyitem。it beobtainedthatvanderWaalsinteractionwasthemain forcefor energy driving complex． words Key MM。PBSA；Moleculardynamics；B．cyclodextrin；Estradiol 环糊精(Cyelodextrins，CDs)具有内疏水、外亲水的特殊D环2种取向从大口端进入3-CD的空腔。 结构，冈此可以和许多小分子形成包结物…。由于这种独特 的性能，CDs已被广泛用于食品、医药等很多领域怛J。雌二 醇属于甾类化合物的一种，是体内主要由卵巢成熟滤泡分泌 的一种天然雌激素，能促进和调节女性性器官及副性征的正 常发育，临床用于卵巢机能不全或卵巢激素不足引起的各种 症状，然而其低溶解性限制了其在药物治疗方面的应用。为 了提高