坛紫菜(Pyropia+haitanensis)核糖体基因簇序列的测定.pdfVIP

第29卷第4 常熟理工学院学报（自然科学） Vol.29No.4 2015年7月 JournalofChangshuInstituteTechnology（NaturalSciences） Jul.,2015 坛紫菜（Pyropia haitanensis） 核糖体基因簇序列的测定 张 皓，何 渊，沈颂东 （苏州大学 医学部基础医学与生物科学学院，江苏 苏州 215123） 摘 要：坛紫菜是我国独有的栽培紫菜物种，而目前对坛紫菜分类学层面上仍缺乏有效的分 子鉴定技术. 本研究通过PCR 方法，对采自福建省莆田海区坛紫菜样品核糖体基因簇序列进行了 测定，目的是为坛紫菜分类及种质鉴定提供分子生物学证据. 测定结果表明，坛紫菜样品的18S rDNA 的全长序列长度为2953 bp ；28S rDNA 部分序列3603 bp ，且不含内含子；5.8S rDNA 长度为 158 bp ，该区域的5 ’端和3 ’端十分保守，在紫菜属中差异较小；ITS 1 的长度为334 bp ；ITS2 为678 bp. 已经测定IGS 区的部分长度为3555 bp ，该区域存在复杂二级结构. 通过对坛紫菜核糖体基因 簇序列的分析表明，其能够成为紫菜分类鉴定与系统演化的分子标记. 关键词：坛紫菜；核糖体；顺反子；系统演化 中图分类号：S917.3 文献标识码：A 文章编号：1008-2794 （2015 ）04-0015- 10 1 引言 紫菜广泛分布于世界各地，自然生长的紫菜数量十分有限，因此目前用作食用以及研究的紫菜主要是 [1] 通过人工养殖，我国紫菜产量居世界首位，紫菜已成为重要的经济海藻之一 . 坛紫菜（Pyropia haitanensis） 隶属于红藻门（Rhodophyphyta ），原红藻纲（Protoflorideophyceae ），红毛菜目（Bangiales ），红毛菜科（Bangiace⁃ ae ），紫菜属（Pyropia ），原产于福建的平潭、莆田、惠安等地，系暖温性海藻，是我国特有的也是主要的栽培品 [2] 种之一，其产量约占全国紫菜产量的75%，是具有重要经济价值的红藻 . 坛紫菜生物学特征类似于红藻门中的其他紫菜，具有异形世代交替的生活史，包括大型的叶状体和小 [3] 型的丝状体两个阶段，叶状体阶段是作为食用的阶段，而对于种质保存则以丝状体阶段为主 . 对叶状体的 形态学描述通常作为区分不同紫菜属的经典分类方式. 实际分类中，研究者更倾向于根据地理位置和其他 [4] 的一些环境条件来进行区分，因此缺乏一些稳定的分类特性是区分紫菜属的一个巨大障碍 . 随着基础研究 的加强，坛紫菜的育种及栽培技术得到了显著提高，但其种质资源的研究暴露出了很大问题，缺乏科学有效 的种质鉴定技术严重影响