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miRNAs在不同物种进化中序列保守性的研究
第 32卷第 3期 辽宁师范大学学报 (自然科学版) Vo1.32 No.3
2009年 9月 JournalofLiaoningNormalUniversity (NaturalScienceEdition) Sep. 2009
文章编号 :1000—1735(2009)03—0351—05
miRNAs在不同物种进化中序列保守性的研究
王上 直莹 ,’ -宋/1、-响’I文八
(暨南大学 生命科学技术学院,广东 广州 510632)
摘 要 :miRNAs在不同物种的进化中存在保守性,不仅单独在动物或是植物中存在保守性,而且在动植物之间也同
样存在.本研究在人和动物的不同组织 中克隆到了同源性很高的序列,将所得结果与 已发表的成熟 的miRNAs比对 ,
发现克隆到的序列与植物中miRNA319家族 的相似性较高 ,并且保守区靠近其 5’端,推测新 miRNAs可能与 miR—
NA319扮演相似 的角色 ,而这些序列 的保守性跨越不 同进化阶段 的物种 ,也为miRNAs广泛的保守性增加新的证据 ,
显示 miRNAs在物种进化过程 中发挥着重要的功能.
关键词 :miRNAs;克 隆;miRNA319;保 守性
中图分类号 :Q349.5;Q522 文献标识码 :A
后基 因组时代开始后 ,在不 同物种体内发现一类数量庞大的微 RNA 家族——microRNAs(miR—
NAs),它是一类非编码的单链小 RNA 分子 ,可通过引发靶标 mRNA 的降解或翻译抑制来介导转录后
基因沉默.这类小分子 RNA在调节组织或细胞 的生长、发育、分化 、凋亡等方面起了重要 的作用n—z].
miRNAs基因表达模式具有分化的位相性和时序性 ,即在不同的组织、不同的发育阶段 中miRNAs的
表达水平有显著差异.对一部分已经发现的miRNAs的研究分析提示 ,miRNAs参与生命过程中一系
列的重要进程,包括早期发育,细胞 的增殖、分化、凋亡 ,脂肪代谢 ,参与原癌基 因等的调控作用.由于
miRNAs主要通过引发靶标 mRNA 的降解或转译抑制的方式来调控其靶基因的表达 ,因此可以通过
调节 miRNAs的表达量而对生物的发育起到调控作用.
随着 miRNAs在各不同物种中广泛地被发现 ,其保守性也变成一个重要的特征.miRNAs的基因在
发育过程中呈保守性的特点.如在已发现的miRNAs中let一7,miR-34,miR-60和miR一87在脊椎动物和无脊
椎动物之间高度保守 ,这说明它们可能有多个识别位点或多个靶标,在不同生物中起着相同或相似的作
用L3j.研究表明,大约70 的哺乳动物miRNA基因是位于TUs区(transcriptionunits,TUs) ,且其中
大部分是位于内含子区.一些内含子 miRNAs基因的位置在不同的物种中是高度保守的,例如:miR一7
在哺乳动物和昆虫 的 hnRNPK(heterogeneousnuclearribonucleoproteinK)蛋 白内含子 区都有发
现 .miRNAs不仅在基因位置上保守,序列上也呈现 出高度的同源性 [7_9].在一种线虫 (Caenorha—
boditiselegans)中所发现的miRNAs,85 都可以在另一种线虫 (Caenorhaboditisbriggsae)的基因组
中找到同源序列 1【.植物中,miR319的同源序列在拟南芥、水稻和烟草中都存在 [11-12].
miRNAs大多数成簇的出现,研究也发现植物中的一些 miRNAs,在动物中也 同样存在表达 ,如拟
南芥 miRNA854在动物线虫 (Caenorhaboditiselegans),小 鼠(Musmusculus)和人 中也发现有显著的
表达 ,同样在动物 中发现与植物 miRNAs相似的序列 ,如在青蛙中发现与植物 miRNA159相似的序
列l1.这些研究表 明 miRNAs在动植物之间也存在保守性,本实验通过从不 同的物种去克隆 miRNAs
序列,经过测序 、比对 ,获得在动 、植物 中相似性较高的miRNAs,这些序列具有共同的保守区,为动植物
中的miRNAs保守性研究提供新的证据.动植物之问miRNAs在进化的过
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