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RAD标记刚开发出来时，是利用基因芯片来进行基因分型。基因芯片快速、高效、自动化。而且，通过设计不同的探针阵列、使用特定的分析方法可使基因芯片技术具有多种不同的应用价值，如基因表达谱测定、实变检测、多态性分析、基因组文库作图及杂交测序等。 * 最后一步是通过基因芯片来实现，红色荧光表示仅S1个体在相应位置有该酶切位点，绿色荧光表示仅S2个体在相应位置有该酶切位点，而黄色荧光表示S2及S1个体均有改酶切位点，而红色与绿色代表了S1与S2个体之间的多态性。这种方法可以很好地应用在非模式生物体中，但低数量的标记限制了他们的应用范围。 * 随着测序技术的发展，将RAD标记与二代测序技术结合对分子标记的开发提供了巨大的潜在价值。 * 在这里给大家举个例子比较好理解，我们是研究芜菁这种植物食材，津田芜菁有个特点，就是见光部分会有色素合成，不见光部分没有色素合成。而它的另一个品种赤丸芜菁见光和不见光部分均有色素合成。为了研究这个差异性状产生的原因，我们就需要通过分子标记将影响该性状的基因定位在染色体某一区段，然后从这一区段中的候选基因中，通过分子手段找出该基因。我们将津田芜菁和赤丸芜菁杂交后获得F2个体，将F2个体分为津田芜菁表型与赤丸芜菁表型，并各选取50株等量混合分为两个池。进行RAD文库的构建。比如有4碱基识别位点的限制性内切酶，有5、6碱基识别位点的限制性内切酶（如果选用4碱基就会获得大