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MD 模拟研究生物小分子在跨膜环肽纳米管中的传输特性 中文摘要 中文摘要 论文包括两大部分。 1. 采用EMD 、SMD 模拟以及ABF 方法，研究了三种生物小分子（O 、CO 2 2 和NH ）在跨膜环八肽纳米水通道中的传输特性。研究表明，NH 分子进出管口 3 3 遇到的阻力最小，在通道中传输时与周围水分子以及管壁形成氢键的能力最强。 除了管口位置，O2 和 CO2 分子在管中很难与管壁发生氢键作用。直接氢键作用 的同时，三种气体分子可以与管壁形成间接氢键作用—水桥。PMF 曲线展示了 通道内α-plane 区域和midplane 区域分别出现势垒和势阱的周期性变化特征，与 SMD