模煳聚类分析方法在DNA序列分类中的应用.pdfVIP

维普资讯 第22卷 第1O期 计 算 机 仿 真 2005年l0月 文章编号：1006—9348(2005)10—0108—04 模糊聚类分析方法在 DNA序列分类 中的应用 顾俊华，盛春楠 ，韩正忠 (东南大学软件学院，江苏 南京210096) 摘要：该文采用模糊聚类分析的方法对DNA序列进行分类。首先从 DNA序列中单个碱基分布的 “密度”角度出发，提取出 DNA序列的特征，然后用模糊聚类分析中常用的方法对DNA序列进行分类。该文运用自行研制开发的集成 11种模糊聚类 分析算法的模糊聚类分析运算工具，首先对已知的1—20个DNA序列进行模糊聚类分析，根据分类结果的精度，找出了较优 的6种聚类分析算法，然后用余下的21—4O个DNA序列进行分类；最后，本文一次对所有的1—40