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单晶结构分析2
X-射线衍射单晶结构分析 (2) 周佳海 jiahai@mail.sioc.ac.cn,第一节课回顾 X射线单晶衍射的历史 X射线的性质(特征X射线、靶、同步辐射) 晶体的周期性与对称性(空间点阵、对称性操作、对称元素) 单晶结构解析 是非题 点阵集中反映晶体结构的对称性特征。(课件1第61页) X射线单晶衍射画面中的每个衍射点都对应于待测分子中的一个原子。(上课重点提到过) 衍射数据质量越高,R值越大。(课件1第32页) 相角?hkl可以直接通过实验测定。(课件1第124页) 通过提高单晶衍射的分辨率,可以提高最终结构的准确度。(错误,应为精确度) 请写出下面国际表相关的晶系、空间群符号和空间群序号。 1958年第一个蛋白质三维结构获得解析 1958年Sanger获得诺贝尔化学奖 1958年中国大跃进开始 1958年提出人工合成胰岛素课题的背景 中国科学院生物化学研究所1月份刚成立 没有相关研究经验,生化所的所有专家都没有做过多肽合成 不明确如何去分析、鉴定合成的中间产物及最终产物 严重缺乏相关原材料,当时国内只能生产纯度不高的甘、精、谷三种氨基酸 1965年我国首次人工合成了结晶牛胰岛素 1974年中国科学家测定的1.8埃高分辨猪胰岛素晶体结构 蛋白质的结构与功能关系远比DNA复杂 蛋白质的功能之二:催化作用 蛋白质的功能之三:分子开关 蛋白质的功能之四:结构单元 蛋白质的三级结构 蛋白质四级结构 蛋白质结构外围的水分子 折叠相似的两个蛋白功能迥异 功能相似的两个蛋白结构不同 X-射线衍射晶体学法测定蛋白质结构 Potency and Selectivity Considerations Direction 1: Targeting Asp48 Significantly Improves Potency 化学生物学与结构生物学 * John C Kendrew Max F Perutz 肌红蛋白结构 贡献:胰岛素的一级结构测定 Frederick Sanger 蛋白质的功能之一:结合作用 醛糖还原酶 磷酸三酯水解酶 门冬氨酸氨基转移酶 D-氨基酸氨基转移酶 Expression/purification crystallization X-ray diffraction phasing Model building Refined structure 实 例 1 Zhong-Yin Zhang, et. al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, 94, 13420. Potency D48/R47 B-site D48 R47 F181 Y46 K120 R24 I219 M258 F52 A27 A site B site G259 A site: the primary active site; B site: a 2nd pTyr binding site Selectivity PTP1B: Gly259 CD45: Leu LAR: Tyr TCPTP: Gly Wan, Z.-K. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16, 4941-4945 Direction 2: Extension into the B-Site Significantly Improves Potency 即时性 可逆性 可调性 可操作性 实 例 2 *
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