狼肠道菌群生态的犬科线粒体基因组比较和系统发育.pdf

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0225 Code:1 University Code:B10009 Register Dissertationforthe ofDoctor Degree BACTERIALDIVERSITYINTHE TRACTOFWOLVESAND ANDPHYLOGENETICANALYSIS0F CANIDAEMITOCHONDRJALGENOMES Candidate: ChenLei Honghai Supervisor: Prof.Zhang Associate Prof.Ma Supervisor: Jianzhang Academic for:Doctor DegreeApplied WildlifeProtectionandUtilization Speciality: Dateof0ralExamination:June,2010 Northeast University: ForestryUniversity 摘要 作为现存食肉目动物中分布最为广泛的类群,犬科动物与人类生活有着千丝万缕的 联系。在对犬科动物的研究过程中,消化生理学领域的研究具有举足轻重的地位,其中 有关消化道菌群生态的研究近年成为学术界的热点话题。尽管目前对家犬肠道菌群的研 究已经比较深入,但是狼的消化道菌群目前仍是个未知数。为了解狼的肠道菌群组成和 多样性特征,本文第一部分通过构建菌群16SrRNA基因文库和进行系统发育分析,对 采集自中国内蒙古自治区达赉湖自然保护区附近的3只健康成年狼的粪便菌群结构进行 了分析。我们将3只狼的粪便样品分别构建16SrRNA基因文库,从中随机挑取550个 克隆进行检测,共得到307个不同的非嵌合体的细菌16SrRNA基因序列。根据97%的 着98个克隆的16S II数据 库中现有序列的相似度小于98%,为未分类、未鉴定的细菌。系统发育分析表明,狼粪 total OTUs),Bacteroidetes(1 其余四个科依次是: Ruminococcaceae, 门和Fusobacteriales门的细菌组成和数量上存在较大差别。 线粒体基因组是比较基因组学研究的理想工具。家犬(Canis lupusramiliaris)的线 粒体全基因组测序于1997年完成,至今已测序的犬科动物有四种:家犬、狼(白,z西 lupus)、郊狼(Canislatrans)和赤狐(VulpesVulpes)。本课题组于2008年对分布于青 海省的西藏狼(Canis lupuslaniger)的线粒体基因组进行了测序。然而,中国分布的其

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