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0225
Code:1
University
Code:B10009
Register
Dissertationforthe ofDoctor
Degree
BACTERIALDIVERSITYINTHE
TRACTOFWOLVESAND
ANDPHYLOGENETICANALYSIS0F
CANIDAEMITOCHONDRJALGENOMES
Candidate: ChenLei
Honghai
Supervisor: Prof.Zhang
Associate Prof.Ma
Supervisor: Jianzhang
Academic for:Doctor
DegreeApplied
WildlifeProtectionandUtilization
Speciality:
Dateof0ralExamination:June,2010
Northeast
University: ForestryUniversity
摘要
作为现存食肉目动物中分布最为广泛的类群,犬科动物与人类生活有着千丝万缕的
联系。在对犬科动物的研究过程中,消化生理学领域的研究具有举足轻重的地位,其中
有关消化道菌群生态的研究近年成为学术界的热点话题。尽管目前对家犬肠道菌群的研
究已经比较深入,但是狼的消化道菌群目前仍是个未知数。为了解狼的肠道菌群组成和
多样性特征,本文第一部分通过构建菌群16SrRNA基因文库和进行系统发育分析,对
采集自中国内蒙古自治区达赉湖自然保护区附近的3只健康成年狼的粪便菌群结构进行
了分析。我们将3只狼的粪便样品分别构建16SrRNA基因文库,从中随机挑取550个
克隆进行检测,共得到307个不同的非嵌合体的细菌16SrRNA基因序列。根据97%的
着98个克隆的16S II数据
库中现有序列的相似度小于98%,为未分类、未鉴定的细菌。系统发育分析表明,狼粪
total
OTUs),Bacteroidetes(1
其余四个科依次是: Ruminococcaceae,
门和Fusobacteriales门的细菌组成和数量上存在较大差别。
线粒体基因组是比较基因组学研究的理想工具。家犬(Canis
lupusramiliaris)的线
粒体全基因组测序于1997年完成,至今已测序的犬科动物有四种:家犬、狼(白,z西
lupus)、郊狼(Canislatrans)和赤狐(VulpesVulpes)。本课题组于2008年对分布于青
海省的西藏狼(Canis
lupuslaniger)的线粒体基因组进行了测序。然而,中国分布的其
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