东乡野生稻重复序列的克隆染色体的物理定位.pdf

Y748009 东乡野生稻重复序列的克隆及染色体的物理定位 研究生：洪义欢 导师； 陈建民教授 (扬州大学生物科学与技术学院，江苏扬州225009) 摘要 水稻基因组中DNA重复序列占了50％左右，重复序列在基因组问扩增和互 渗的机理还不十分清楚。克隆和定位这些重复序列，以及对这些重复序列的分析 将有助于更好地理解染色体结构特征及重复序列功能的研究。 本实验以细菌人工染色体(BAC)用于东乡野生稻基因组文库的构建，通过 菌落原位杂交初步筛选得到可能含有特异重复序列的BAC阳性克隆。对其中一 筛选得到七个含有不同的重复序列的亚克隆，序列分析表明BAC克隆来自水稻 第5号染色体的着丝粒附近，该七个重复单位在多条染色体上都有分布，与水稻 基因组indica序列相关克隆的同源性达到了90％以上，且在各条染色体上存在不 同的拷贝数，比较发现序列不完全相同，但不同拷贝之间同源性很高。以该BAC 克隆为探针，通过荧光原位杂交(FISH)对其进