《2011年上海地区轻、重症手足口病患者肠道病毒71型分离株VP1、VP4区的基因特征分析》.pdfVIP

· 12· 临床论著 ● 201 1年上海地区轻、重症手足口病患者肠道 病毒71型分离株VP1、VP4区的基因特征 分析 蔡韵 申惠国 李治俊 居丽雯 蒋露芳 熊海燕 姜庆五 【摘要】 目的 了解2011年上海地区手足口病重症和轻症患儿中肠道病毒71型(EV71)分离 株VPl、VP4区的基因特征。方法对来自2011年重症与轻症手足口病患儿的各5株EV71分离 株进行VPl、VP4全序列的RT—PCR扩增测序，并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71A、B、 C基因型代表株进行核苷酸、氨基酸比对分析和系统进化分析。结果 轻、重症患儿的EV71分离 株之间VPl基因的核苷酸同源性为96．0％～98．1％；VP4基因的核苷酸同源性为93．7％～ 99．5％。轻、重症患儿的EV71分离株与C基因型代表株比较接近，VPl区核苷酸同源性分别为 86．9％～98．2％、87．4％～98．5％，VP4区核苷酸同源性分别为85．5％～100．0％、84．5％～ 99．5％，其中与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株(C4亚型)VPl区核苷酸同源性分别可达 97．0％～98．2％、97．9％～98．5％，VP4区核苷酸同源性分别可达96．1％～i00．0％、97．1％～ 99．5％。3例重症患儿分离株在VPl和VP4的天冬酰胺(N)282丝氨酸(S)、苏氨酸(T)7丙氨酸(A) 同时发生变异。结论2011年上海地区10例轻、重症手足口病患儿中分离的EV71流行株均属C 基因型的C4亚型；3例重症患儿分离株在VPl和VP4的N282S、T7A同时发生变异。 【关键词】手足口病；肠道病毒A型，人；基因，病毒；序列分析；基因型；变异(遗传学) ofVPlandVP4 ofenterovirus71strainsisolatedfromsevereandmildhanD- Sequenceanalysis genes foot-mouthdiseasecasesin CAI Yun’，SHEN Shanghai，China，2011 Hui—guo，LIZhi—jun，JULi— IANG IANG wen，J Lu一厂nng，XIONGHai—yan，J Qing—WU．’DepartmentofEpidemiology，School Public Public Health，Fudan Education， of University，KeyLaboratoryof Health，Ministryof Shanghai200032，China author：JIANG CorrPs户o”ding Qing—WU，Email：jiangq@fudan．edu．cn VP4 ofenterovirus To theVPland 71(EV71) [Abstract]Objectiveanalyze geneticregion in isolatedfromseverecasesandmildcaseswithhanD-foot—mouthdisease(HFMD)in2011． Shanghai MethodsFiveEV71strainsisolatedfromseverecasesandfiveEV71strainsfrommildcasesin2011 wasusedtO wereincluded．Reverse chainreaction(RT-PCR)me