《5种家蚕病毒的密码子及密码对使用模式分析》.pdfVIP

ScieDceof5ericulture 2012，38(2)：0273—0280 ISSN 32—1115／S 0257-4799；CN E-mail：CYKE@chinajournal．net．cn 5种家蚕病毒的密码子及密码对使用模式分析 石生林1，2，3李苗苗2’3姜义仁2’3杨瑞生2’3秦利1’2’3 ．． 究中心，沈阳110866) 摘要通过分析5种家蚕病毒基因组密码子和密码对使用模式，初步探讨5种家蚕病毒的基因组进化和对宿主的适应策 密码对(codon．pair)等进行统计分析的结果表明：5种家蚕病毒的密码子偏好性均较低，病毒间的碱基组成及ENe值差异较 小，碱基组成对密码子使用模式影响较小；不同病毒选择不同的偏好性密码子，不同病毒的密码对偏好性程度不同，其中，家 maeula-like 蚕类葡萄斑点病毒(肋础声mori BmCPV)和家蚕核型多角体病毒(Bo．a,y宜mori 蚕浓核病毒(Bombyx infee- fiousflachene 密码对使用模式相似。5种病毒的偏好性密码子和偏好性密码对不同，显示不同病毒的密码子和密码对的进化路径不同，对 宿主的适应策略不同。 关键词 家蚕病毒；碱基组成；密码予；密码时 中图分类号鼹84．5 文献标识码A 文章编号0257—4799(2012)02—0273—08 onCodonand PatterninFiveSilkworm Analysis Codon-pairUsage I■I VIrUSeS SHI LIMiao．Mia02·3JIANGYi—Ren2·3YANG QINLil·2·3‘ Sheng．Linl’2-3 Rui—Shen92·3 1 ofBio- PostdoctoralStationofPlant 10866，China；2 (1 Protection，ShenyangAgriculturalUniversity，ShenyangCollege sconceand 11 Resource University，Shenyang0866，China；3EntomologicalEngi- Biotechnology。ShenyangAgricultural ResearchCenterof 110866，China) neering LiaoningProvince．Shenyang AbstractGenomic totheirhostsoffive were evolutionand silkworm(Bombyxmor『)virusesprelimina· adaptivestrategy studied on codonandcodon-pairpatterns．Base ry throughanalysisgenomic usage and numberof