3基因组的结构与功能.ppt

鲁云霞制作 第三章 基因组的结构与功能 重点：基因组的概念，各类生物基因组的特点。 难点：各类生物基因组的结构特点。 基本要求： 掌握基因组的概念、各类生物基因组的结构特点； 熟悉基因的转位与插入； 比较和了解各类生物基因组的差异。 本章主要内容 第一节 基因组的概念 第二节 病毒基因组的结构特点 第三节 原核生物的基因组 第四节 真核生物基因组 第五节 基因组变异的意义 第六节 人类基因组学简介 第一节 基因组是一套完整单倍体的遗传物质的总和 一、基因组储存了生物体整套的遗传信息 基因组（genome）泛指一个细胞或病毒的全部遗传信息。在真核生物体中，基因组是指一套完整单倍体DNA(染色体DNA)和线粒体DNA的全部序列，既包括编码序列，也包括大量存在的非编码序列。 人类基因组包含22条常染色体和X、Y两条性染色体上的全部遗传物质（核基因组）以及胞浆线粒体上的遗传物质（线粒体基因组）。某些病毒的基因组由RNA组成。 二、不同生物基因组蕴含的遗传信息量有着巨大的差别 基因组的大小通常以其DNA含量来表示，单倍体基因组中的全部DNA量称为C值（C-value）； 不同生物的基因组大小差异很大。基因组大小和DNA含量随着生物进化复杂程度的增加以及生物结构和功能复杂程度的增加而逐步上升； C值矛盾：如人的C值只有109bp，肺鱼的C值为1011bp； 基因组的大小与基因的数目没有直接的线性关系。 不同生物物种的基因组大小比较 第二节 不同病毒基因组的核酸具有不同特点 病毒（virus）是最简单的生命形式，遗传信息的延续构成了生命活动的主要内容。 病毒基因组的主要功能就是保证基因组的复制及其向子代传递，整套基因组所编码的蛋白质都是与基因复制、病毒颗粒包装以及向其它宿主细胞传递密切相关，有些蛋白质可影响宿主细胞基因表达和增殖，通过促进细胞的增殖而有利于病毒复制繁衍。 一、病毒基因组核酸的主要类型 病毒基因组（virus genome）的核酸有DNA，也有RNA，但不会二者共存。 按照核酸的性质、基因组结构及复制的特点，可以将病毒基因组分为以下几类： ① 双链DNA如腺病毒是线状双链，乳头瘤病毒是环状双链； ② 单链DNA：如ΦX174； ③ 双链RNA如轮状病毒含有正负两条RNA链； ④ 单链负股RNA如流感病毒需要先合成与其互补的mRNA； ⑤ 单链正股RNA如SARS；逆转录病毒通常引起人和动物的肿瘤，如HIV可作为mRNA行使模板功能。 SARS病毒简介 SARS冠状病毒属于单股正链RNA病毒； RNA分子不分节段，5端有甲基化帽，3端有polyA结构，基因组长度在27000～30000碱基之间； 5端约2/3的区域编码病毒RNA聚合酶蛋白，后1/3的区域编码结构蛋白，依次为S蛋白(spike protein)，E蛋白(envelop protein)，M蛋白(membrane protein)，N蛋白(nucleocapsid protein)等; 在结构蛋白编码区可能的ORF中，能编码在已知蛋白质序列数据库中未找到任何同源序列的未知蛋白PUP (predicted unknown protein) 。 部分RNA病毒基因组可以被反转录成DNA 逆转录病毒是一类特殊的单股正链RNA病毒，通常引起人和动物的肿瘤； 逆转录病毒基因组一般包括3个基本的结构基因，即gag、pol、 env，分别编码核心蛋 白、逆转录酶和膜蛋白。 二、病毒基因组结构与功能的特点 ① 不同病毒基因组大小相差较大 乙肝病毒（HBV）DNA为3.2kb，所含信息量较少，只能编码几种蛋白质；而痘病毒基因组DNA长达300kb，可编码几百种蛋白质。 ② 不同病毒基因组可以是不同结构的核酸 病毒基因组的核酸可能是DNA，也可能是RNA；可能是单链，也可能是双链；可能是闭合环状分子，也可能是线性分子。 ③ 病毒基因组有连续的也有不连续的 DNA 病毒基因组均由连续的DNA分子组成；多数RNA病毒基因组也由连续的核糖核酸链组成，但有些则以不连续的核糖核酸链组成。 ④ 病毒基因组的编码序列大于90％ 病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质的，只有很小部分不编码蛋白质。 ⑤ 单倍体基因组 除逆转录病毒基因组有两个拷贝外，至今发现的病毒基因组都是单倍体，每个基因在病毒颗粒中只出现一次。 ⑥ 基因有连续的和间断的 感染细菌的病毒（噬菌体）基因组与细菌基因组结构特点相似，基因是连续的；而感染真核细胞的病毒基因组与真核生物基因组结构相似，有内含子，基因是间断的。 ⑦ 相关基因丛集排列 病毒基因组核酸序列中功能相关的几个蛋白质基因丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成一个功能单位或转录单元，受同一个转录调控