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蛋白质对接算法与实践 摘要 蛋蛋蛋白白白质质质对对对接接接算算算法法法与与与实实实践践践 摘摘摘 要要要 蛋白质-蛋白质相互作用与识别的研究是分子生物学领域的重要课题，其中一项 重要的研究内容是蛋白质分子对接。由于实验测定蛋白质对接复合物结构比较困难， 因此，通过计算机模拟预测分子间结合模式的对接算法受到极大关注。迄今为止已 有比较成功的蛋白质对接预测算法如ZDOCK、AutoDOCK与Rosetta计算平台等。在 很多蛋白质-蛋白质对接方法中，几何匹配是最为重要的打分方式，因此如果能够改 进目前的几何匹配模型，将会对对接方法有所帮助。这些蛋白质对接算法各有其优 缺点，普遍对计算的蛋白质对象有较高的敏感度。 蛋白质对接算法有着广泛的应用。细胞内的很多重要生理过程如细胞信号传导、 免疫反应、基因复制、转录、翻译以及细胞周期调控等，都是通过蛋白质复合体或 蛋白质分子间相互作用来完成的，要充分理解和认识这些复杂生理过程，必须要解 析蛋白质复合物结构并了解蛋白质相互作用过程发生的构象变化。蛋白质对接算法 使用计算机