第四节 蛋白质的三维结构2.pptVIP

六、 超二级结构和结构域 定义： 蛋白质中，由若干相邻的二级结构单元（如?-螺旋、?-折叠、 ?- 转角）组合在一起，彼此相互作用，形成有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体，以充当三级结构的构件，称为超二级结构。 （二）结构域（structure domain） 1. 定义： 七、球状蛋白质与三级结构（tertiary structure） （一）定义 （二）球状蛋白质分类 希腊钥匙型 （三）球状蛋白质三级结构的共同特征 含有多种二级结构元件。 具有明显的折叠层次。 紧密的球状或椭球状实体，但活性部位具松散区域，以利于构象变化。 疏水侧链埋藏在分子内部，亲水侧链暴露在分子表面。 分子表面有一个空穴（裂缝、口袋、凹槽），是结合配体并行使生物学功能的部位。 （四）三级结构举例 位于肌红蛋白表面的疏水洞穴内。 例2： 胰岛素的三级结构 A链：21aa，A12-A15为非标准的右手螺旋。（白色） B链：B1-B6为伸展的折叠肽链；B8为Gly，发生转折； B9- B19为右手螺旋；B21-B23为转角结构； B23-B27为伸展的β构象。（蓝色） 八、蛋白质的折叠 （一）蛋白质的变性 （二）氨基酸序列规定蛋白质的三维结构 蛋白质的三级结构由一级结构决定，是肽链上各个单键旋转自由度受到各种限制的总结果。 （三）蛋白质折叠的热力学 （四）蛋白质折叠的动力学 九、蛋白质的四级结构（quarternary structure） （一）定义 （三）寡聚蛋白质与别构效应 别构效应（allosteric effect） 2. 同促效应和异促效应 ? 同促效应（homotropic effect） （三）血红蛋白的四级结构与功能 Hemoglobin Hb, 血红蛋白 is a well-studied and well-understood protein. One of the first proteins to have its molecular mass accurately determined. The best understood allosteric protein. The first protein to be associated with a specific physiological function. 在血液中结合并转运O2 The first protein with a single amino acid substitution being related to a genetic disease the beginning of molecular medicine . 1. 血红蛋白的结构 （1） 寡聚蛋白质: Mr. 65000。具四个亚基（?2?2 ），每个亚基与一个血红素分子结合。 （2）一级结构: ?: 141aa ?:146aa 9个保守残基：F8 His ?87, ?92 ; E7 His ?58, ?63 等 （3） 二、三级结构： ?和?链与Mb 相类似 2. 血红蛋白的功能与别构效应 （2） 血红蛋白的氧合曲线及生理意义 （3）H+、CO2对血红蛋白结合氧的影响 （4）BPG对血红蛋白结合O2的影响 3. 血红蛋白分子病 例：镰刀型细胞贫血症（sickle-cell anemia） 波尔效应（Bohr effect）： HbO2 + H+ + CO2 在肌肉中 在肺部 Hb H+ CO2 + O2 H+和CO2是血红蛋白别构效应的负效应物。 H+结合部位： ? 链C-末端His146咪唑基, ? 链N-末端Val ?-氨基等。 CO2结合部位：4个亚基N末端?-氨基 稳定T态，促进氧的释放。 Fig. 1-63 Renaturation of unfolded, denatured ribonuclease, with reestablishment of correct disulfide cross-links. 限制因素： 肽键的硬度、二面角可允许的角度、亲水基和疏水基的数目和位置、R基与溶质和溶剂的相互作用等。 生物大分子“自我装配”原则: 在这些限制因素下，通过R基的彼此相互作用以及R基与溶质和溶剂的相互作用，最后达到平衡，形成在一定条件下热力学最稳定的空间结构。 在生理条件下，折叠结构是自由能最低的的构象。多肽链的折叠是自发过程，△G ? 0。 1. 多肽链是分步快速折叠的 U M N 伸展态 熔球态 天然态 疏水收缩 二级结构的形成 折叠步骤： 完全的伸展态 局部二级结构（?或?等） 初始结构域 熔球态 天然蛋白质 *成核作用（nucleation） 协同聚集 装配 构象调整 2. 需要酶和蛋白质因子的参与 蛋白