GBr4-SA模型计算二肽的溶剂化自由能.pdfVIP

第 38卷第 3期 辽宁师范大学学报 (自然科学版) Vol_38 No．3 2015年 9月 JournalofLiaoningNormalUniversity (NaturalScienceEdition) Sep． 2015 文章编号 ：1000—1735(2015)03—0344—05 doi：10．11679／lsxh1k2O15O3O344 应用PCM和ABEEM／GBr4．SA模型计算二肽的溶剂化自由能 赵东霞， 郭威威 ， 马 悦 (辽宁师范大学 化学化工学院，辽宁 大连 116029) 摘 要：使用 B3IYP／6—311++G(d，p)方法优 化 了极 性的Gly、Ser、Cys、Asn、Gln和 Thr二肽 以及非极性的Ala、Pro、Val、Met、Leu、lie、Phe和 Trp二肽的结构 ，然后使用 MP2／aug—cc—pvdz／PCM 方法分别计算了这些二肽在水、四氢呋喃、氯仿和四氯化碳溶剂 中的溶剂化 自由能．应用 ABEEMd 浮动电荷极化分子力场，在 298K、NVT系综下分