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树干毕赤酵母cna文库构建及est序列测定
摘 要
将植物纤维水解液中30%左右的术糖有效利用转化为酒精是降低酒精生产成本的关
键。树干毕券酵母是研究得最多、最具工业应用前景的木糖发酵酵母,目前对于树干毕赤
酵母木糖代谢的生理学孝惩铡还赧之甚少。
SequenceTag,表遮窿歹|j标签)羧术是一秘
以eDNA文瘁为基舔靛EST(Expressed
快速的进行撼因功能分卡斤及发现新基因的有效方法。本论文构建了树干毕赤酵母P5776
(PichiaStipitisCBS
疼列溅定,为黪母鲍基因沩能分辑、本耱我落途径磷究蚨及舞选蠢芙瞧状基困爨供了基礁
l
工其。 {
以具有不同生长速率的树干毕赤酵母为材料提取RNA,发现处于对数中期(OD600约
为2.1)的酵母细胞易于提取出总RNA;分别以匀浆法、玻砂法、液氮研磨法以及液氮速
冻宓硅滚氯磷黪的方法酸碜缀驻,再分嬲蔽TRIZOL(苯酸弱买酸酸鬣黢蕊均一溅会镑)弱
交性裂解滚(主要成分楚§一巯基乙醇粒异硫酸氰瓢)为试剂在溶解P5776细胞缀分的同时
保持其中RNA的完整性,通过苯酚和飘仿多次抽撮除净杂蛋白,以异丙醇沉淀回收特异
的保留在水朦中的RNA,最后经乙醇洗涤得到备用RNA。结果发现,运用变憔裂解液,
采取滚氧速冻趣滚氮骚壤麴方法提取黪霹缎鼹RNA,效果夷好。零论文鞋约900mg(干
完整性,质激高,是eDNA文库构建的良好材料。
以提取出的RNA为树料,纯化出mRNA(messagerRNA,信使RNA),经反转录酶反
转录出cDNA第一链,戳嚣换会戏法会残eDNA双链,逶过荻筑铯溺羧瓣方滚薅透窭其
中大于500bp的片段与载体连接,最詹两电转化法转化宿主菌,构建出树干毕券酵母P5,76
units,噬菌斑
的eDNA文库,经质量检测,初级文库滴度达到1.0×106pfu(plaqueforming
300bp,这蘸eDNA文疼稳建要求,竞念哥鞋弱予大筑模EST窍舞溅定及数鬃努褥。
eDNA文库铺布麓自斑筛选平板,挑取其中的自斑(即黧组子)经
将扩增好的P5776
Chain
Reaction,聚会酶链式
其有该雩}黪RNA聚合酶褒动子)为雩|锈经PCR(Polymerase
反应)扩增出重组子插入片段,标记上荧光染料后强ABI
不可读辕蓥数小手5%。
今后主鼹工作设想怒进行EST数据分析,并结合cDNA文库制备树干毕赤酵母DNA
芯片,为木糖发酵酵母的缴物信息学研究提供基础。
关键调;本糖;楗予擎赤酵母;cDNA文疼;表达摩歹《瑟签’
ofeDNA and
Construction
library
ESTs ofPichia
st驷it/s
sequencing
FanYi.min
Yu and
Professors Min·—ren
by Shi·-yuanHuang
Supervised
of
Chemical
(College Engineering,Nanj
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