2010创腾生命科学基础班-QSAR与ADMET.pdfVIP

单击此处编辑母版标题样式 DS 2.5.5 中的QSAR、ADMET 单击此处编辑母版文本样式 TOPKAT方法介绍和应用 第二级第二级 第三级 第四级 赵冬梅 dmzhao@ 第五级 2010-7-20 腾科技生命科学暑期培训班基础班创腾科技生命科学暑期培训班基础班 内容 • QSAR - QSAR概述 - 2D-QSAR - 3D-QSAR • ADMET • TOPKAT 1 内容 • QSAR - QSAR概述 - 2D-QSAR - 3D-QSAR • ADMET • TOPKAT QSAR必要性 药物发现 1010种化学种化学 用途用途：：具有抗炎具有抗炎、、镇痛镇痛、、 基团 解热作用。适用于治疗 风湿性关节炎、类风湿 性关节炎、骨关节炎、 强直性脊椎炎和神经炎 等 4 合成的化合物物总数数为10 ，太多！！！ 解决方法： 合成一小部分的化合物，根据这些化合物的构效关系预测其他位置化合物 的活性——QSAR方法！ 2 QSAR必要性 环境科学 低碳生活 生态风险评价 • 现有化学品数目庞大，大量有毒污染物 • 迁移和转化，对生物体毒性，对生态系 统的结构和功能的影响。 • 数据的获取要通过实验获得，工作量之 大是可想而知的。 QSAR概述 定量构效关系(Quantitative Structure Activity Relationship，QSAR) • 采用数理统计方法研究和揭示化合物活性与其分子结构或理化特性之间的定 量变化规则 • 利用寻找到的活性与分子性质间的定量变化规则，预测新的化合物的活性 • 广泛应用于药物、环境科学、农业化学、毒理学等领域 • 成功案例：Lipinski’s Rule of Five 结构 活性 表征 建模 描述符 借助结构参数构建数学模型来描述化合物结构和活性之间的关系 3 QSAR概述 生物活性 = Function (描述符) y = ax1 + bx2 + cx3 + … y生物活性 因变量(Dependent variable) xx描述分子性质的描述符描述分子性质的描述符 自变量自变量(Independent(Independent variable)variable) 目的：找到y与x1 、x2、 x3… 的相关性 挑战：建立生物活性（因变量）与大量描述符（自变量）之间的 关系（线性或非线性） 描述符的改变（结构的变化） 活性的变化 QSAR应用 local and global