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桑树钙调蛋白基cdna克隆分析及桑属植物分子系统学研究
学 号:
文 摘: 桑树是多年生的重要经济作物,桑叶是家蚕的优良饲料。我国
作为世界蚕业的发祥地和起源中心,拥有世界上最为丰富的桑树种
质资源,是一个桑树资源大国。但是,与其它植物相比,我们在桑
树功能基因克隆等方面都处于落后状态。蚕业作为我国传统的优势
出口创汇产业,一旦主要桑树功能基因的控制权旁落它国,将对我
们的桑产业会造成不可估量的影响。所以,我们应该立足于我们的
资源优势,开展桑树功能基因挖掘研究。另外,利用丰富的桑树种
质资源开展桑属系统发育和分子进化研究,对丰富的桑树遗传资源
收集、整理、保存和创新利用有着重大意义。本文研究内容如下:
利用SMART 技术(Switching Mechanism At 5 end of RNA
Transcript)构建丰驰桑幼苗cDNA文库,从中获得两个cDNA序列,
两条序列的读码框均为450 bp ,均包括完整的3端非翻译区;序列
比对分析发现,两条序列ORF(open reading frame) 同源性为86%,
核苷酸差异大多数发生在第3位密码子上;将其氨基酸序列与
GenBank上登陆的拟南芥ACaM-7等的氨基酸序列进行比对,同源
性均在98% 以上,说明是2 个钙调蛋白基因,命名为MCaM-1 ,
MCaM-2 ;其中MCaM-1与拟南芥的CaM7、胡萝卜的CaM4 的氨基
酸同源性达100%。这表明钙调蛋白序列在植物中相当保守。
用PCR 产物直接测序法对桑科桑属、构属等属的 14 份材料的
trnL 基因内含子序列进行了测定:该序列长度变异范围为534~561
bp ;平均核苷酸组成为 0.39100(A) 0.27114(T) 0.17679(C)
0.16086(G) ,平均A+T 含量为0.66214 说明该序列富含A/T 。利用
rps16 基因内含子对桑科桑属、构属等属的20 份材料进行了分子系
统学研究,各供试材料rps16 基因内含子长度在887~922 bp 之间;
平均核苷酸组成为0.36055(A) 0.31305(T) 0.14215(C) 0.18435(G),平均
A+T 含量为 0.67360, 说明该序列富含 A/T 。用软件对所得序列进
行分析并构建了其系统发育树。构建的两棵系统树均显示桑属所有
材料聚为一类,进一步证明桑属为单系,并探讨了桑属的亲缘关系。
用两个标记进行的分析结果有很多的相似处,但也有差异。
关键词: 桑树,钙调蛋白,SMART,trnL 内含子,rps16 内含子
Abstract : Mulberry (genus Morus), grown as a perennial tree or shrub, is an
economically important plant used for sericulture, as it is the sole food
plant for the domesticated silkworm, Bombyx mori . As the homeland and
origin center of the world sericulture, our country has abundant mulberry
germplasm resources. Compared with other p
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