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皖北黄牛种群随扩增多态性dna研究
摘要
纹相似率作了亲缘关系聚类。实验共采集31头皖北黄牛的耳组织样,采用高盐与氯
物可以得到稳定的扩增产物,其中仅有l条引物的扩增产物表现为单态,3条弓【物的
扩增产物具有多态性。利用能够产生多态性的引物对样本群体进行RAPD和类平均
聚类分析.共得到清晰的带纹382条、扩增片段有19种,平均每个引物每一个体扩
增带纹4.04条,所获得的标记数为4~7个,标记分子大小范围为O.25~2.00kb,各条
扩增带纹以及5、4和3种多态标记带,共有200条为多态带纹,多态性扩增片段的
百分比为52.36%。据此计算了3个多态性引物对于每两个个体之间的带纹相似率、
而作的聚类分析显示,两两个体间的遗传距离范围为1.97~14.5,结果表明:
1.在秦川牛、云南和贵州的黄牛品种中10条多态性随机引物已被文献证明是可
靠的,在皖北黄牛的I认PD.PCR中却只有4条引物能够完全扩增出产物。其中引物
s1043扩增产物属于单态,说明皖北黄牛与这三个品种之问存在较大的遗传差异。
反映的遗传交异信息最大,产物的带纹最多,多态性较好;s40反映的遗传变异信息
在整体上反映样本个体间基因杂合度较高,群体内具有一定的遗传变异。
3.亲缘关系的聚类结果表明,个体间的带纹相似率参差不齐.但除个别个体外,
各个体问的距离都很近。大部分个体遗传距离均在3.5~5.5之间,也显示该样本群体
的遗传距离在一定的范围内分布较为均匀。
此外,本文还就RAPD技术在家畜遗传育种中的应用和目前肉牛QTL定位及基
因组的研究现状.探讨了RAPD在未来中国黄牛育种和保种中的应用前景。
关键词:黄牛R艚D遗传多样性聚类分析
索经侮{一毛:加阀基
Il
白垒文公一檀
Abstract
wereselecteda11dusedtDmaketlle DNA
1bnrandomprimers polymo咄icaIlalysis
rates deducedandarolative
WanBei caItle.ThebaIld were
fRAPD)ofycllow simiJ撕ty
individu“eartissue werefet6hed
analysishasbeen samples
reIationShip made.Tllirty—one
with
f如mtlle DNAwasextracted
sampkherd,andgenomic lligh·salt-chloroformrapid
methodinthc DNA tissue
average150~300肚gpcfO,02~O.059
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got.RAP【).PCRsystemestablished.Four叫mersget
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