原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
2008年柯萨奇病毒A组16型昆明分离株KMM08全基因组序列分析.pdf
·220· J
中华流行病学杂志2012年2月第33卷第2期Chin
Epidemiol，February
·实验室研究·
2008年柯萨奇病毒A组16型昆明分离株
KMM08全基因组序列分析
马绍辉潘明 何春艳陈俊英施海晶 孙强明 李琦涵
【摘要】 目的分析柯萨奇病毒A组16型(CAl6)昆明分离株KMM08全基因序列，了解其
遗传特性。方法设计针对CAl6引物，提取病毒RNA，RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列。
3．5．1等软件分析全基因序列。结果获得KMM08全基因组核苷
利用Mega4．1，RDP3和SimPlot
酸序列长度为7409bp，编码含2193个氨基酸残基的多聚蛋白；与其他CAl6参考株核苷酸和氨基
酸同源性分别为79．0％～98．2％和94．5％～99．3％，其中SZ．HK08—3与国际标准株G10核苷酸和氨
基酸同源性分别79．1％和94．8％；而与肠道病毒71型(EV71)标准株BrCr同源性分别为78．7％和
89．0％。在各个区段上，KMM08与SZ．HK08．3的核苷酸和氨基酸同源性分别为97．0％一99．0％和
98．0％一100．0％，同源性最高；与G10的核苷酸和氨基酸同源性分别为74．2％～86．9％和90．9％～
97．0％；与Ev71BrCr核苷酸和氨基酸同源性分别在65．O％～84．9％和71．0％一95．2％。进化分析
发现KMM08属于B基因型的一个分支。RDP3和SimPlot3．5．1软件分析发现Tainan一5079。98序
列发现重组信号，而KMM08未发现。结论KMM08分离株为B基因型；CAl6与Ev7l在非结构
区发生重组。
【关键词】柯萨奇病毒A组16型；全基因组；序列分析
ofahumancoxsackievirusA16strainKMM08isolatedin
Completenucleotidesequence
in2008i垤AShao-hui，PAN
Kunming。China Yue，HEChun—yah，CHENjun-ying，SHIHai-jing，
Vaccine onSevere
JsE，ⅣQiang—ming．LIQi．han．yunnanKeyLaboratoryof ResearchDevelopment
MedicalSciencesand Union
Disease，InstituteofMedical of
lrtfectious Biology，ChineseAcademy Peking
Medica2 650ll
8．China
College．Kunming
1cn．com
Correspondingauthor：Oi．han，Email：qihanli@2
Science China
Thisworkwas a fromtheNational and
supportedby grant TechnologyMajorProjec船of
(No．2008ZXl0004-014)．
of
Todescribethe characterization froma
【Abstract】Objective ge
文档评论（0）