乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系HA1基因的分子进化研究.pdfVIP

·366· ·监钡Ⅱ· 乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系 HAl基因的分子进化研究 金青青 茅海燕孙逸卢亦愚 冯燕徐昌平 莫世华 【摘要】 目的探讨乙型流感病毒两大谱系的进化特征和进化规律。方法从GenBank数 据库下载1940—2012年乙型流感病毒流行株共126条，采用贝叶斯一马尔科夫链一蒙特卡洛 (Bayesian．MCMC)和分子钟方法，对乙型流感病毒的HAl基因进行系统发育学分析，计算乙型流 感病毒两大谱系可能的起源时间与分化时间。结果 1978--2010年乙型流感病毒Victoria系与 Yamagata系的aa平均差异率为5．4％～10．2％，两谱系的aa差异和组间遗传距离随时间推移呈逐 渐增大的趋势。与Victoria系毒株相比，Yamagata系全部毒株的163位aa及部分毒株的166位aa 缺失，但是这些年来的乙型流感病毒HAl基因除个别位点外，尚未受到明显的正向选择压力。每 年乙型流感病毒HAl基因的碱基替换速率为2．138×10。3(95％HPD：1．833×10～。2．437×10。)替 代／位点，推算乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系的最近共同祖先出现在1971年(95％HPD： HPD：1975—1978年)。结论乙型流感Victoria系和Yamagata系均较以往发生大的变异，且两大 谱系的差异Et趋增大，将来有可能分化为不同的亚型，在流感监测中应密切关注这一变化及其流 行病学意义。 【关键词】 乙型流感病毒；HAl基因；贝叶斯一马尔科夫链一蒙特卡洛方法；分子钟方法；进化 Molecularevolutionoftwo relatedtoinfluenzaBvirusbasedonHAl jiN Hneages gene Yi2，LU Yah2，xU Shi—hua2．1Medical Q跏g—qin91，朋rADHai-yan2，SunYi-yu2，FEⅣG Chang．pin92，M0 School 3l 521 1，China；2 ProvincialCentreDisease ofNingboUniversity，Zhejiang，NingboZh巧iang for ControlandPrevention author：LU CorrespondingYi-yu，Email：luyiyuzjh@yahoo．com．cn This workwas the ProvincialNaturalScienceFoundation supportedbygrants#omZhejiang To the characteristicsandrulesoftwo on 【Abstract】0bjectiveevolutionary study lineages influenzaBvirus．MethodsAtotalof126HAl ofstrainsisolated 1940to2012 sequences during weredownloadedfromtheGenBank．Timeofthemostrecentcommonancestor(TMRCA)and ofthetwo werecalculatedbasedonthedatafrom ofHAl divergence lineages phylogeneticanalysis MarkovChainMonte molecularclockmethod． gene．usingBayesian C