可变数目串联重复序列技术用于中国C群脑膜炎奈瑟菌基因分型的研究.pdfVIP

· 生堡速堡疸堂盘查；!!!生!旦笙!!鲞篁!塑堡垒也』垦E!!!里i!!!』!!!!!!!!y!!：!!!盟!：! ·595 ·实验研究· 可变数目串联重复序列技术用于中国 C群脑膜炎奈瑟菌基因分型的研究 田国忠 邵祝军 李马超 高源 徐丽 崔志刚 任红宇 王艳华 【摘要】 目的利用脑膜炎奈瑟菌基因组中可变数目串联重复序列(VNTR)特征，对中国C群 脑膜炎奈瑟菌菌株进行基因分型。方法 中国C群脑膜炎奈瑟菌菌株109株，选择脑膜炎奈瑟菌 DNA中4个vNTR位点，PCR扩增含有串联重复序列的DNA片段，选择每一个VNTR位点有差别 GelDocTM 的PcR产物进行测序，序列比对，测算串联重复序列的拷贝数。Bio_Rad xR凝胶成像分 析系统计算PCR产物DNA片段的碱基含量，换算成串联重复数；对109株菌株4个位点的串联重复 序列拷贝数进行聚类分析，依据聚类分析结果进行基因分型，并将VNTR基因分型结果与脉冲场凝 109株C群脑膜炎奈瑟菌菌株分为22个VNTR基因 胶电泳基因分型(PFGE)结果进行比较。结果 型，同一暴发来源的菌株具有相同VNTR特征；VNTR基因分型方法与PFGE基因分型具有相关关 系。结论应用vNTR技术可以对中国C群脑膜炎奈瑟菌进行基因分型和分子流行病学方面的研 究，vNTR基因分型可较好地应用于追溯流行性脑脊髓膜炎暴发传染源。 【关键词】c群脑膜炎奈瑟菌；可变数目串联重复序列；基因分型 0f to of usevariable_numbertandem ex啪ine Study蚰the repeats ge耻ticdiVersityNPfssPr缸m棚ln鲥fid括 inChinaTL4。N Cisolates Z矗“—J甜以，LjMn一如no，l：、AOy“口粗，XULi， serogroup G“o一2矗Dng，SHAo CLH Z危i一胛挖g，RENHb咒g_w，W4卜『GYb卵一矗“口．』、妇fio胛以j，z觑￡“地D，CDmm“理i∞6跆Dis∞卵C0艘frof 口咒dP，·P御行fio超，C矗i咒e5已CP靠fPr加rDis∞s耵GD咒f，．0Z盘咒dP，℃己盱，z￡io起，B西砸以g102206，China GDr，·gsZ】o村di理gn“￡矗or：1s凇oZ矗“一i“以，Email：shaozhujun(少icdc．cn of To thevariablenumbertandem of 【Abstract】Objectivestudy repeats(VNTR)genotyping strainsdiscoveredinChina．MethodsWe selected109 serogroupC№i55PriⅡm已行i，zgifid毋 randomly VNTR10ciin werestudied． serogroupC优已ni卵gUc∞矗strains．FburNPis卵r缸优8规i，zg缸弘妇DNAgenome 10ciwere The numbersofcopiesinthefourVNTR studied chai