宁夏地区2008年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析.pdfVIP

·实验室研究· 宁夏地区2008年柯萨奇病毒A组16型 VP 1区基因特征分析 王东艳陈慧严冬梅张勇安军静马江涛祝双利 马学昊安洪秋许文波 【摘要1 目的研究宁夏地区2008年引起手足i=i病(HFMD)暴发的柯萨奇病毒A组16型 (CVAl6)的基因特征。方法对宁夏地区2008年IIFMD患者临床标本中分离到的CVAl6，采用 反转录一聚合酶链反应(RT-PCR)进行VPI编码区基因扩增，对扩增产物进行核苷酸序列测定和分 析。根据Vial区核苷酸序列与国内其他省份以及国际报道的CVAl6株序列(来源于基因库)构建 基因亲缘关系树。结果共分离到70株CVAl6，其在VPl区核苷酸和氨基酸同源性分别为 90．8％一100．O％和98．9％一100．O％。亲缘进化树显示全部CVAl6株可分为A和B两个基因型，B 基因型又可分为Bl和B2两个基因亚型。宁夏地区CVAl6全部属于B1基因亚型，同时包含Bla 和Blb两条进化分支，提示存在两大传播链。结论宁夏地区分离的CVAl6株与国内其他地区 CVAl6株类似，有BIa和Bib两个进化分支在共同循环，且与周边国家和地区流行的CVAl6在基 因亲缘关系和流行时间关系上都很接近，存在共同进化和循环。 【关键词】手足口病；柯萨奇病毒A组16型；Bl基因亚型；进化分支 Genetic of isolatedin Hlli in eharacterizationcoxsackievirmA16 2∞8 NingxiaMunicipality 黝』、，G Hui2，YAN yo赡1，AN Dong-yanl，CHENDong-meil，ZHANGJun-jin91，MJiang-ta02，删U Wen．b01．1 InstituteViralDiseaseControland Shuang．1i1。心Xue．min2。ANHong-qiul，XU for Prevention，CAineseDiseaseControlandPrevention。State Molecular Centerfor KeyLaboratory Virology Genetic Health V‰ternPacific Poliovirus Engineering．WorldOrganization RegionRegionalReference Correspondingauthor：XU耽几．bo。Email：wenbolab@hotmail．com Th／sworkwas theNationalScienceFoundationChina(Noand supportedbygrantsfrom of NationalScienceand the“EleventhFive．Year China(No． TechnologySupportProjectsfor Plan”of 2008BAl56800)． To the characterizationofcoxsackievirus 【Abstract】Objective A16(CvAl6) studygenetic strainsisolated all of mouth Hui duringepidemichand，foot，anddisease(HFMD)inNingxia in2008．MethodsClinical werecollectedfromHFMD in Hui Municipality samples