基于EST-SSR的福建地区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(5):1720-1727 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.05.027 基于EST-SSR的福建地区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析 刘 振，姚明哲，王新超，陈 亮 （中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心/ 国家茶树改良中心，杭州 310008 ） 摘要： 【目的】通过对福建地区茶树资源进行遗传多样性和亲缘关系分析，为今后茶树亲本选择或遗传改良 等提供依据。【方法】利用中国农业科学院茶叶研究所茶树分子生物学实验室新开发的23对和他人3对共26对 EST-SSR 引物对福建省的42份茶树种质资源进行PCR扩增，在所得相似系数的基础上进行UPGMA聚类，并绘制亲缘关系树 状聚类图。【结果】26 对引物共检测到等位位点 86 个，每个引物为 2～5 个，平均 3.31 个；遗传多态性信息含 量（PIC ）在0.05～0.75，平均值为0.56。期望杂合度（H ）大小在0.02～0.81，平均值为0.60；观测杂合度（H ） e o 在 0.02～0.97，平均值为 0.55；群体内的 Shannon 指数为 1.16。按相似系数为 0.40 可将参试的 42 份种质资源 分为两大类。【结论】研究发现福建地区茶树资源具有相对较高的遗传多样性，并明确了不同资源间的亲缘关系。 关键词：福建；茶树；EST-SSR；遗传多样性；亲缘关系 Analysis of Genetic Diversity and Relationship of Tea Germplasms Originated from Fujian Province Based on EST-SSR Markers LIU Zhen, YAO Ming-zhe, WANG Xin-chao, CHEN Liang (Research Center for Tea Germplasm and Improvement, Tea Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences/National Center for Tea Improvement, Hangzhou 310008) Abstract: 【Objective 】 Genetic polymorphism of tea germplasms from Fujian, China and their relationships were analyzed so as to offer some information to be used in genetic improvement and parental selection in tea breeding programs. 【Method 】 The 26 pairs of EST-SSR primers, including 23 newly derived by the authors and 3 from previous references, were used to analyze the 42 tea accessions from Fujian, China. Based on EST-SSR data, a dendrogram was constructed using UPGMA method. 【Result 】 Totally 86 alleles were amplified us