水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析.pdfVIP

水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析.pdf

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中国农业科学 2013,46(24):5123-5131 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.24.006 水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析 1,2,3 1,2,3 1,2,3 1,2,3 1,2,3 1,2,3 姜兆远 ,任金平 ,刘晓梅 ,邹晓威 ,郭晓莉 ,王继春 , 2 2 4 5 温嘉伟 ,刘文平 ,夏海丰 ,洪德志 1 2 3 (吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心,长春130033; 吉林省农业科学院植物保护研究所,吉林公主岭136100; 农业部东北作物有害 4 5 生物综合治理重点实验室,吉林公主岭136100; 吉林省通化市农业科学院,吉林通化135007; 吉林省农业技术推广总站,长春130021) 摘要:【目的】分析水稻接种稻瘟病菌(Magnaporthe grisea )48 h 后亲和互作与非亲和互作反应的基因表 达谱,探索水稻对不同稻瘟病菌抗性差异的分子机理。【方法】运用Affymetrix 表达谱芯片分析差异表达mRNA; 通过分子注释系统平台(MAS 3.0 )对差异表达基因进行了基因注释及GO 分析;应用实时定量PCR 对部分差异表 达基因进行验证。【结果】在49 824 个转录本中共检测到大约24 000 个转录本,Fold change 大于2.5 的基因共 1 028 个,其中非亲和互作上调基因 460 个,下调基因 568 个。所验证的 4 个基因的荧光定量PCR 结果与芯片结 果基本一致。经GO 分析差异基因对应蛋白的功能主要涉及信号转导、酶的调节、转录及分子转运等。【结论】水 稻与稻瘟病菌非亲和与亲和互作的基因表达谱存在较大差异,基因芯片筛选到的差异表达基因通过GO 注释明确了 差异基因的分子功能及信号通路,有利于进一步了解植物抗病机制,并可能为稻瘟病防治措施提供新的途径。 关键词:稻瘟病;基因表达谱;基因芯片 Comparative Analysis of Gene Expression Profiles of Rice Responding to Different Races of Magnaporthe grisea JIANG Zhao-yuan1,2,3, REN Jin-ping1,2,3, LIU Xiao-mei1,2,3, ZOU Xiao-wei1,2,3, GUO Xiao-li1,2,3, WANG 1,2,3 2 2 4 5 Ji-chun , WEN Jia-wei , LIU Wen-ping , XIA Hai-feng , HONG De-zhi 1 2 ( Northeast Agric

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