甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性.pdfVIP

中国农业科学 2012,45(2):320-329 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.02.014 甜樱桃DFR 基因内含子2 和内含子3 的多态性 1 1,2 1 1 1 1 王 廿 ，鄢锦辉 ，张开春 ，王 晶 ，张晓明 ，闫国华 1 2 （ 北京市农林科学院林业果树研究所， 北京 100093； 北京市大兴区兴海学校， 北京 100076） 摘要：【目的】研究70 个甜樱桃品种DFR 基因多态性与果皮颜色的相关性。【方法】通过DNA 序列分析，以 不同果皮颜色的10 个甜樱桃品种 （Prunus avium L.）为材料，检测DFR 基因的多态性。根据多态性出现的位点 设计特异引物，通过PCR 扩增检测70 个甜樱桃品种DFR 基因的多态性。【结果】获得甜樱桃DFR 基因约1 kb 的片 段，测序结果用BLAST 分析发现，其核苷酸序列与樱桃李（Prunus cerasifera）的核苷酸相似性为80 %，预测 的氨基酸序列与已知的甜樱桃（P. avium）DFR 氨基酸序列相似性达99 %。该片段由3 个外显子和3 个内含子组 成，2 个多态性位点分别在内含子2 和内含子3 上。在黄色、黄底红晕和红色果皮3 个组的70 个甜樱桃品种中发 现3 个单倍型，共5 种单倍型组合。通过SAS 9.0 软件分析发现，所检测到的DFR 基因的等位基因频率在黄底红 晕果皮品种组和红色品种果皮组中的分布无显著差异。【结论】本研究在甜樱桃DFR 基因座上得到2 个差异位点， 分别在内含子2 和内含子3 内，其优势基因频率依次为：0.864 和0.679；但未发现DFR 基因内含子2 和内含子3 的多态性与果皮颜色之间存在直接关系。 关键词：甜樱桃；DFR 基因；果皮颜色；等位基因频率；基因多态性 Polymorphism of DFR Gene Intron 2 and Intron 3 in Sweet Cherry 1 1,2 1 1 1 1 WANG Nian , YAN Jin-hui , ZHANG Kai-chun , WANG Jing , ZHANG Xiao-ming , YAN Guo-hua 1 2 （Institute of Forestry and Pomology, Beijing Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Beijing 100093 ；Xinghai School of Daxing District in Beijing, Beijing 100076) Abstract: 【Objective】 The relationship between polymorphism of DFR gene and pericarp colors was studied in 70 sweet cherry varieties. 【Method】 DNA sequences analysis was applied to detect the polymorphism of DFR gene in 1