同安钮夜蛾核型多角体病毒pst I-G片段克隆及序列分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(7):2373-2379 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.07.015 同安钮夜蛾核型多角体病毒pst I-G片段克隆及序列分析 1 1，2 1 1 1 常润磊 ，林 同 ，张宇宏 ，张 琪 ，温秀军 1 2 （华南农业大学林学院，广州 510642 ； 华南农业大学经济林研究中心，广州 510642 ） 摘要：【目的】测定同安钮夜蛾核型多角体病毒（OpdiNPV）pst I-G 片断的序列，了解OpdiNPV的遗传结构 和与其它昆虫病毒的进化关系。【方法】用pst Ⅰ酶切病毒基因组，电泳分离并回收pst I-G片段，连接到PUC18， 转化入 E.coli DH 5α，挑取阳性菌落测序。【结果】该片段长度为5 056 bp，有4个ORF，分别编码ODV-E66 的 C末端（EU 623602），P87/VP80的C末端（EU 732665），ODV-Ec43（EU617337）和Ac108（EU 732666）。ac108 基 因和odv-ec43 起始密码子上游都有1个晚期启动子结构域TAAG，odv-ec43 基因起始密码子上游有2个早期转录 起始元件CAGT；由 odv-ec43 推导的蛋白有2个跨膜螺旋、3个N-糖基化位点、1个N端酰基化位点、7个PKC 磷 酸化位点、1个酪氨酸激酶磷酸化位点和4 个CKⅡ磷酸化位点； p87/vp80 基因终止密码子下游有polyA信号。【结 论】氨基酸序列同源分析和相似性分析显示Ac108、ODV-E66和 P87/VP80与其它昆虫病毒差异较大，ODV-Ec43 的 保守性较高。 关键词：同安钮夜蛾核型多角体病毒；odv-e66 基因；odv-ec43 基因；ac108 基因；p87/vp80 基因 Sequence Analysis of the pst I-G Genomic Fragment of the Ophiusa Disjungens Nucleopolyhedrovirus 1 1,2 1 1 1 CHANG Run-lei , LIN Tong , ZHANG Yu-hong , ZHANG Qi , WEN Xiu-jun 1 2 ( College of Forestry, South China Agricultural University, Guangzhou 510642; Research Centre of Economic Forest of South China Agricultural University, Guangzhou 510642) Abstract: 【Objective 】 In order to investigate the genomic organization and phylogenetic status of OpdiNPV. 【Method 】 OpdiNPV DNA was digested with pst Ⅰ and separated by el