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pcr_mtda技术鉴别检测固原鸡源性成分的研究
摘要
本研究以宁夏地方品种固原鸡(白羽、红羽、麻羽)、引进肉鸡品种AA鸡和蛋用品种罗曼鸡
全序列为基础,设计用于扩增固原鸡、从鸡、罗曼鸡线粒体DNA控制区(D—LOOP)、细胞色素b
物,并对PCR扩增产物进行测序。通过生物学软件对所得序列进行比对,分析品种间的遗传差异,
探讨线粒体不同基因在鉴别检测鸡品种源性成分利用方面的可行性,筛选出适合鉴别检测固原鸡
源性成分的可靠目的基因。研究结果表明:
1 D-L00P基因发现14个变异位点,3个缺失/插入位点及11个转换位点,其中固原鸡与从鸡、
罗曼鸡在品种问发现6个变异位点;从鸡在490位点缺失了一个C碱基,在199位点发现一个
特异性变异位点,发生了C/T的转换;罗曼鸡在860位点发现一个特异性变异位点,插入了一
个C碱基。固原鸡三个类群(白羽、红羽、麻羽)内发现6个变异位点。红羽在490位点缺失
C/T的转换,在15位点发现一个特异性变异位点,插入了一个A碱基。
2
位点发生了A/G转换。固原鸡三个类群(白羽、红羽、麻羽)内没有发现变异位点。
3 Cytb基因在品种间发现1个变异位点,在364位点发生了C/T的转换。固原鸡三个类群(白羽、
红羽、麻羽)内没有发现变异位点。
4
羽、红羽、麻羽)内没有发现变异位点。
本研究结果将为鉴别检测宁夏地方品种固原鸡源性成分提供重要的理论根据,并对固原鸡
品种种质资源的合理利用和保护提供一些科学依据。
关键词:固原鸡,遗传差异,D—LOOP基因,COI基因,Cytb基因,12srRNA基因
Abstract
Inthis oflocalvarietiesin
study,thestudy NingxiaGuyuanchicken(whitefeather,redfeather,
Ma introduction
feather),the ofbroilervarietiesArborAcreschickenand varietiesRomanchicken
egg
asthe
tested chain
varieties.UsingPCR(thepolymerase
reaction)amplificationtechnology,and
chicken
mtDNAtoGenBank(accession based to
number:AB003323)sequenceson.Designed
amplify
the Acres chickenDNA
Guyuanchickens,Arbor Control
chicken,Roman District(D.LOOP),
b cofactor
cytochrome Coxidasesubunit
de‘multiplexingenzyme(Cytb),cytochrome
I(c01),
12srRNA andPCR were
genesequenceslimitfragment—specificprimers amplificationproducts
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