北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析.pdfVIP

第36卷 第lo期 海 洋 学 报 voI．36，N0．10 2014年 lO月 AC A OCEANOLOGICA SINICA October2014 王桢，李阳，车帅，等．北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析CJ3．海洋学报 ，2014，36 10 ：1l6—123，doi：10．3969／j．issn． O253—4193．2O14．1O．O12 WangZhen，I．iYang，CheShuai，eta1．DiversityanalysisofculturablebacteriaisolatedfrommarinesedimentsofArcticEJ]．Acta OceanologicaSinica inChinese ，2014，36 10 ：116—123，doi：10．3969／j．issn．0253—4193．2014．10．012 北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析 王桢 ，李阳 ，车帅 ，林学政 1．国家海洋局 第一海洋研究所 国家海洋局海洋生物活性物质重点实验室，山东 青岛 266061 摘要：利用Zobell2216E培养基和涂布平板法对北极海洋沉积物 中可培养细菌进行分离纯化，并利用 16SrRNA基因进行分子鉴定与系统发育分析。根据菌落形态学特征，从 59个站点的沉积物样 品中 共分离纯化获得 570株细菌；基于 168rRNA基因的分子鉴定与系统发育分析表 明，分离到的可培养 细菌分别属于细菌域的4个门，5个纲，l2个 日，23个科，47个属，102个种，其中 Proteobactria占绝 大多数；有 14株菌株与模式菌株的16SrRNA基因序列相似性小于 97 ，为 6个潜在的新种。北极 海域的海洋沉积物中存在着丰富的微生物种质资源，为开发新型生物活性物质和特殊功能基因打下 了基础。 关键词 ：北极；海洋沉积物；细菌多样性；系统发育分析 中图分类号：P722．1；P727；Q939．1 文献标志码 ：A 文章编号 ：0253—4193 2014 10一O116—08 是巨大的基因遗传变异库 ]。因此 ，本研究对于北极 1 引言 地区深海沉积物中微生物的种质及其多样性研究具 极地具有独特的地理、环境及气候特征，其主要 有重要的意义。 特点是变化极大的光照辐射、季节性的光照时间、常 北极区域的微生物多样性研究主要集 中在海水 年极低的水温 通常在一1．8～2．0。C 和高盐度环境 一 海冰生态 系统 中；此外 ，北极海水 中的浮游微生 海水中的盐度一般为 34～35，海冰中盐囊和盐通道 物[3和冰川中的微生物多样性研究也有报道_l4]，而对 的盐度可达普通海水的 5倍 ，形成 了一个酷寒、强辐 北极区域海底沉积物中微生物的研究则较少，并且集 射和高盐度的 自然环境 ]。北极地 区蕴含着丰富的 中在某些特定代谢类型，例如硫酸盐还原菌等 引。 微生物种质资源，由于其特殊 的地理位置和气候条 对北极环境中的微生物进行大范围的分离培养 ，并在 件 ，生存于其中的微生物大多有其特殊的生理生化特 此基础上进行其微生物多样性分析仅在北极海冰样 性和代谢特征。由于数万年的沉积作用，深海沉积物 品中得到了开展_l7]。 成分繁复，是非常复杂的微生物栖息地。有机质是微 相对于北极的广阔水域和特殊气候条件，已有研 生物易利用的物质和能源，而深海沉积物中有机质含 究结果并不能全面反映北极海域 中的微生物种质资 量比海水中的要多 1O～10倍；同时，深海沉积物也 源多样性，因此还需进一步研究调查。2012年 7 9 收稿 日期 ：2014—03—16；修订 日期 ：座机电话号码。 基金项目：南北极环境综合考察与评估专项 CHINARE2012—03—05，CHINARE2013 03 05 。 作者简介：王桢 1989～ ，山东省烟台市人 ，主要从事极地微生物学研究 。E-mail：座机电话号码9@qq．corn *通信作者 ：林学政 ，研究员，主要从事海洋微生物及其应用学研究 。E-mail；linxz@fio．org．cn 1O期 王桢等：北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析 月中国第五次北极科学考察对北极海域海洋沉积物 试管中，充分混匀，经适当系列稀释后，取 5O L涂布 进行了大面积调查并采集了样品，本文通过原位涂布 于2216E培养基平板上 ，于 4C低温培养箱 中倒置培 培养、分离纯化及分子鉴定与系统发育分析 ，分离培 养 15d。根据菌落形态学特征，挑取不同的单菌落进 养并发现了大量新的细菌种质资源。这些资源对于 行进一步的分离纯化。 了解北极海域海洋沉积物微生物的多样性 、发现新 的 2．3 分子鉴定与与系统发育分析 微生物种质资