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北沙柳种质资源遗传多样性的ssr分子标记分析
摘 要
北沙柳是杨柳科柳属多年生灌木,具有很高的生产和饲用等价值,是防风固沙的
先锋植物。本研究采用 SSR 分子标记技术,对国家种质资源保存库内 9 个不同产地的
北沙柳种群进行了遗传多样性分析,旨在为北沙柳种质资源库管理以及优良无性系选
育提供科学依据。研究结果如下:
5
1 采用 L (5 )正交表,获得北沙柳 SSR-PCR 的适宜反应体系:DNA 模板为 90ng,
25
引物 1.2 μmol/L,dNTP 浓度为 0.5mmol/L,TaqDNA 聚合酶 1.5U,10×buffer 为
6.25 μM。SSR 的PCR 扩增条件为:94℃预变性 2min,94℃变性 40s,54℃退火 1min,
72℃延伸 2min,共 30 个循环,4℃保存。
2 利用从 45 对 SSR 引物中筛选出 12 对多态性高、重复性好的 SSR 引物,在 9
个北沙柳种群中,扩增得到 73 条带,多态性百分率为 86.3%,每对引物扩增位点数 2~
18 不等,平均每对引物扩增 6.1 个位点;引物等位位点多态信息含量为 60.27%~
72.60%,平均值为 66.36%。Shannon′s 信息指数变幅在 0.2382~0.2934 之间,平均
为 0.2687。
3 用遗传相似系数对 9 个北沙柳种群进行 UPMGA 聚类分析,在相似系数 1.8301
处将 9 个北沙柳种群聚成两大类群。利用 POPGENE1.32 软件计算种群间的遗传相似系
数 (GS)变异范围为0.9318~0.9846,表明北沙柳种群间存在一定的遗传变异。
4 通过基因型研究北沙柳种群无性系之间的遗传相似系数发现伊金霍洛旗扎萨
克镇门克庆嘎查这一种群内无性系的遗传相似系数最大值为 89%,明显低于其它种
群,具有作为苗木选育来源地的潜能,而乌审旗查汗淖尔和呼拉胡社这两个种群内无
性系间遗传相似系数小于 64%组合数分别为 4 和 2,表明该种群中的北沙柳无性系具
有开展选择育种的潜力。
关键词:北沙柳;SSR 分子标记;遗传多样性;种质资源库
项目研究获得国家沙柳种质资源保存库无性系的分子签定(高等学校博士学科点专项
研究基金)和国家沙柳种质资源保存库建设(国家林业局)的资助。
Genetic Diversity Analysis of Salix psammophila Germplasm Resource by
SSR Molecular Markers
Abstract
Salix psammophyla belongs to salicaceae. It is a perennial shrub with high product and feed value
etc,Which is the pioneer plant of wind-breaking and sand-fixing.In this study,using SSR markers were
used to detected genetic diversity and relationship among 9 populations of Salix psammophyla which
were collected from different producing area.The objectives of this study are to provide basis for Salix
psammophyla genetics and breeding research.The results showed as follows:
5
1 Using the L25 (5 )table of Orthogonal ,study on the SSR-PCR reaction condition,An
optimization system of SSR markers was established,which the 25μl PCR recation buffer consisted of
DNA 9
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