广西狂犬病病毒基因聚合酶活性部位的克隆与序列分析.pdfVIP

广西狂犬病病毒L基因聚合酶活性 部位的克隆与序列分析 摘要 本实验对广西毒株狂犬病病毒L基因聚合酶活性部位进行克隆 和测序，截取L基因聚合酶活性部位核苷酸和推定的氨基酸序列与国 外固定毒株和类狂犬病毒株进行比较分析。 结果显示广西毒株与国外固定毒株的L基因聚合酶活性部位的 核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为84．8％．87．5％和94．5％．99％， 与类狂犬病病毒株的核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为75．5％ ．79．2％和93．5％．97％，广西各毒株之间的核苷酸和推定的氨基酸同 源性较高，分别为88．7％．99．8％和96．5％．100％。 根据L基因聚合酶活性部位的核苷酸序列对广西狂犬病毒株作 遗传进化分析，可以将广西毒株分成3个群，群I：GX08、GX09、 GX、ⅣX； GXNll9。 比较了L基因聚合酶活性部位氨基酸的变异情况，广西毒株L基 因聚合酶活性部位的特有变异为第660位、745位和771位，其中在 I L基因的第745位点上，广西毒株全部为精氨酸，而在该位点的国外 参考毒株为丝氨酸、亮氨酸或组氨酸；在660位点上，广西毒株中 GXLA、GXSL和GXWX株为丙氨酸。 比较L基因聚合酶活性部位，发现其4个基序高度保守，其中基 序A保持不变；基序B、C、D只有少数氨基酸发生变异，基序C中 的核心序列GDNQ在各毒株中都不变。 关键词：狂犬病病毒聚合酶同源性序列分析 L CLONINGAND ANAIYSISOFGENE SEQUENCE ACnVITYMODULERABIESVIRUS POLYMERASE OF ISOI。pdESFROMGUANGXI ABSTRACT Inthis theeDNA theL study fragmentscontaininggenepolymerase ●’ moduleofrabiesvirusisolatesfrom weredonedand activity Guangxi nucleotideofL moduleandtheir sequenced．Thesequencegeneactivity deducedaminoacid were withthoseofotherrabies sequencecompared virusstrainsandrabies-relatedvirusstrains publishedpreviously． ofthenucleotide deducedaminoacid and Comparison sequence of moduleofrabiesvirusisolatesfrom sequencespolymeraseactivity fixed withthatofother rabiesvirusstrainsandrabies—related Guangxi virus nucleot