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应用代谢组学批量数据分析工作流程表 征细菌中的差异代谢物 应用简报 作者 摘要 本文应用发现代谢组学的精确质量 Q-TOF LC/MS 工作流程，研究了处于早稳定期和晚 Yuqin Dai 和 Steven M. Fischer 稳定期的细菌。所采用的软件可批量处理数据，使得数据分析更高效且实现了自动化。 安捷伦科技公司 应用 Agilent MassHunter Profinder （批量特征提取软件）总共从正离子数据中获得 美国加利福尼亚州圣克拉拉市 了 488 个特征，从负离子数据中获得了 623 个特征。采用 Mass Profiler Professional (MPP) 进行的统计学分析揭示了细菌在早稳定期和晚稳定期丰度具有显著差异的特征。 在正离子数据中，有 57 个特征在早稳定期中的丰度要高于晚稳定期。而在负离子数据 中，有 个特征在早稳定期中的丰度要明显高于晚稳定期。为了理解这些代谢组学数 52 据的生物学和生物化学背景，我们通过数据库搜索、精确质量 MS/MS 谱库匹配，以及 MS/MS 分子结构关联对超过 100 个差异特征进行了标注和鉴定。 对于 分析，使用 水 乙腈 通过使用等度泵持续注入参比质量溶液进行 前言 LC/MS 500 µL / 溶液对样品进行重悬，然后涡旋混 动态质量轴校准。表 和表 汇总了优化的 (3:7 v/v) 1 2 人们对于细菌生长的研究已有超过一个世 合并离心。将上清液从 Eppendorf 管转移至 LC 和 MS 条件。 纪的历史，研究成果包括由 Jacob Monod 1 干净的 LC/MS 样品瓶中。 提出的细菌生长期的经典定义 。研究表明， 数据分析软件 细胞在晚稳定期依然存活且代谢活跃，但是 仪器 • Agilent MassHunter 定性分析 晚稳定期的细胞对刺激或压力的响应与早稳 定期的细胞并不相同。研究人员假设细菌在 采用与 Agilent 6230 TOF 系统或 Agilent (Qual) B.07.00 6550 iFunnel Q-TOF 联用的 Agilent 1290 稳定期中产生的一种或多种代谢物会导致细 • Agilent MassHunter Profinder