大规模并行粒子模拟系统代码级优化研究和实现.pdfVIP

第25卷第9期 计算机与应用化学 V01．25．No．9 2008年9月28日 and ComputersAppIiedChemistry 大规模并行粒子模拟系统代码级优化研究与实现 何牧君L2，郭力1，严历1’2 摘要：粒子方法作为一种直观而且普适的模拟方法，在化工、材料、生物等领域应用愈加深入，其对计算机软硬件的要求亦越 来越高，在原有的硬件设施上如何才能经济高效的实现性能的大幅度提升，成为目前粒子模拟研究人员所关注的问题之一。 本文通过在多相复杂系统国家重点实验室高性能计算集群上进行大量的测试工作与分析，利用了多项技术，包括0penMP、 SSE等对大规模并行粒子模拟系统模拟程序代码层面进行优化，并对系统的未来进一步优化提出建议。 关键词：粒子模拟；并行计算；英特尔C++；编译器；0penMP；SSE 中图分类号：TP39 文献标识码：A 文章编号：1001．4160(2008)09．11cr7．1110 Researchand of in siIIlula-