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nuclear primers.doc
1、胡桂兵,林顺权,叶自行,徐昌杰,张上隆杧果LEAFY 同源基因的分离及序列分析. 亚热带植物科学,2004,33(2):1-4
在比较其它物种上已克隆的LEAFY 基因序列的保守区后设计一对长度均为23bp 的特异引物,上游引物:5’-GAAGTGGCGCGTGGGAAAAAGAA-3’;下游引物:5’- CGGAGCTTGGTGGGAACGTACCA-3’。PCR 体系:10×PCR 缓冲液(含Mg2+)5.0μl,dNTPs(各自2.5mmol/L)4.0μl,上游引物1.0μl,下游引物1.0μl,模板DNA4μl,Ex Taq(5U/μl)0.5ìl,加灭菌双蒸水至总体积50μl。扩增程序为:94℃变性5min 后,按94℃,50s→55℃,70s→72℃,150s 进行35 个循环,最后72℃延伸10min 结束。
刘月学 , 胡桂兵, 林顺权, 刘宗莉, 陈厚彬. 枇杷L EAFY同源基因的克隆及序列分析华南农业大学学报, Vol. 26 , No. 2
比较其他物种上已克隆的LEAFY (LFY) 序列保守区后设计了1 对长度均为25 bp 上海生工公司合成.
上游引物A: 5′GARGTGGCGCGCGTGGSAARAAGAA-3′;
下游引物: 5′-CAGAGYTTGGTGGGMACRTACCA-3′.
10 ×PCR 缓冲液、DL2000 DNA 分子标准、Taq 酶、dNTP 均购自TaKaRa 公司, 其他试剂均为分析纯试剂.
反应体系为:10 ×PCR 缓冲液(不含Mg2 + ) 510μL ,MgCl2 (25 mmol·L - 1) 410μL ,dNTP 混合物(各25mmol·L - 1) 410μL ,上游引物(10μmol·L - 1) 110μL ,下游引物(10μmol·L - 1 ) 110μL ,模板DNA 110μL , Taq酶(5 U·μL - 1) 015μL ,加灭菌双蒸水至总体积50μL.扩增参数为: 94 ℃变性5 min 后, 按94 ℃, 40 s ;51 ℃,60 s ;7115 ℃,90 s 进行30 个循环.
李建安, 孙 颖, 陈鸿鹏, 刘丽娜, 郭文丹. 油桐L EAF Y 同源基因片段的克隆与分析.中南林业科技大学学报 28( 4): 21-26
应用生物信息学软件V ecto r N T I 9. 0 将多种植物的L F Y 基因组DNA 序列进行比对分析后, 根据保守区设计1 对引物并由上海博尚公司合成, 序列如下.
F1: 5′CGGA GTTTGGTGGGMACRTACCA -3′
R1: 5′-CARGGGTGCGCGCGGTGAA GTTA -3′
反应体系: 10×PCR Buffer (M g2+ F ree) 2. 0 LL; dN TP s (10mmo l?L ) 1. 6 LL;M gCl2 (25mmo l?L ) 1. 2 LL; 引物F1 (10 Lmo l?L ) 0. 8 LL; 引物R1 (10 Lmo l?L ) 0. 8 LL; 模板DNA 0. 5 LL; TaqDNA 聚合酶(5U ?L ) 0. 1 LL; 加超纯水至总体积20. 0 LL.
反应条件: 94 ℃变性3 m in; 94 ℃变性30 s, 61 ℃退火30 s, 72 ℃延伸2 m in, 35 个循环; 72 ℃延伸5 m in;
曾黎辉、王庆莲、洪自同、吴少华. 龙眼LEAFY同源基因片段的克隆和表达. 热带作物学报,27(4):69-73
比较其他物种,如柑橘[15]、葡萄[16]、苹果[17]、西洋梨(GenBank 序列号AB162030)、杧果( AY189684)等,已报道的LFY/FLO 同源基因序列3′端保守区后,设计了一对简并引物。上游引物序列为:5′- GAGGGAGCACCC(G/A)TTCATTGTGAC- 3′;下游引物序列为:5′- GTACCAGATCGAGAGACGGGGATG- 3′。反应体系为:10×PCR Buffer (Mg2+ Plus)5.0 μL、10 mmol/LdNTPs 4.0 μL、上游引物(10 μmol/L)2.0 μL、下游引物(10 μmol/L)2.0 μL、Taq 酶(5U/ μL) 0.5 μL、cDNA( 或DNA)2.0 μL,加无菌ddH2O 至总体积50 μL。反应条件是:94 ℃预变性2 min;94 ℃变性30 s,55 ℃退火40 s,72 ℃延伸30 s,30 个循环;72 ℃延伸7 min。PCR 产物电泳照相并直接用于测序。引物由上海博亚/英俊生物技术有限公司合成;测序委托上海博亚/英俊生物技术有限公司和TaKaRa 生物工程(大连)有限公司
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