依据16s rna基因和16s-23s rrna基因间隔区对鸭疫里默氏菌进行系统发育分析.pdf

摘要 本试验对鸭疫里默氏菌(RA)l～19型的参考菌株及代表亚型、变异株和未定型的7个分离株 共26个菌株的16srRNA基因以及16S-23S rRNA基因间隔区(ISR)进行了研究，旨在进一步明确 RA的系统发育位置，阐明RA16SrRNA基因和ISR的分子特征．并为RA分离株的鉴定、RA 感染的快速诊断及流行病学研究奠定技术基础。 用细蓥通用引物扩增出RA接近全长的16SrRNA基因，经克隆测序后进行了序列分析。 BLASTN结果显示，RA与鸽子里默氏菌、动物溃疡伯杰氏菌和粘金黄杆菌之间的16SrRNA基 因序列同源性最高．这些细菌在系统发育树上共同占据一个独立的rRNA分支，结果进一步表明， RA属于rRNA总科V黄杆菌科的里默氏菌属。 获得了鉴定RA的4个分子指标。26个RA菌株之间的16S rRNA序列相似性为99．1～100％， 而黄杆菌科中所有可用于分析的菌属内，种间序列差异均大于l％小于10％，提示1％以内的16S rRNA基因序列差异可作为鉴定RA的判断标准。用通用引物扩增的26个RA菌株16SrRNA基