TNF-a基因多态性及和奶牛乳房炎的相关性分析.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2010 9 , 32(9): 929 ―934 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00929 TNF-基因多态性及其与奶牛乳房炎的相关性分析 徐阿娟, 刘小林, 郭家中, 夏志 , , 712100 以417 头中国荷斯坦奶牛为研究对象, 根据体细胞评分(Somatic cell score, SCS) 的大小将该奶牛群体划 分为感染牛群(100 头)和健康牛群(317 头) 。通过 PCR-RFLP 和 CRS-RFLP 方法检测了肿瘤坏死因子(Tumor necrosis factor-alpha, TNF-)基因在荷斯坦奶牛群体中的多态性, 并分析这些多态位点和奶牛乳房炎的相关性。 研究发现了3 个单核苷酸多态位点(Single-nucleotide polymorphism, SNP): 第2 外显子39 bp 处G→A 的突变; 第 4 外显子293 bp 处 C→T 的突变; 5′侧翼区(5′-flanking region, 5′UTR)C→G 的突变。这3 个突变位点分别是Dra Ⅰ、 Afa Ⅰ和Dde Ⅰ限制性内切酶的酶切多态位点, 其中 Dra Ⅰ为创造酶切位点。经过基因型分析与χ2 检验表明: 3 个酶切多态位点在荷斯坦奶牛群中均未达到Hardy-Weinberg 平衡状态。运用SPSS 13.0 软件, 采用最小二乘 拟合线性模型分析3 个酶切多态位点与SCS 的关系, 结果表明: AA 基因型个体在Dra Ⅰ酶切位点中的SCS 显著 大于BB 及AB 基因型个体(P0.05), BB 基因型表现出乳房炎抗性。Afa Ⅰ酶切位点中BB 基因型个体的 SCS 显 著大于AA 及AB 基因型个体(P0.05), AA 基因型表现出乳房炎抗性。Dde Ⅰ酶切位点中, AB 基因型个体的SCS 显著 低于AA 基因型个体(P0.05), AB 基因型为优良基因型。因此BB 、AA 、AB 基因型分别为Dra Ⅰ、Afa Ⅰ、Dde Ⅰ酶切位点中的优良基因型, 可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。 TNF-基因; PCR-RFLP; 多态性; 乳房炎; 相关性 Polymorphism of bovine TNF- gene and its association with mastitis in Chinese Holstein cows XU A-Juan, LIU Xiao-Lin, GUO Jia-Zhong, XIA Zhi Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture, Animal Science Technology College of Northwest A F University, Yangling 712100, China Abstract: Four hundred and seven Chinese Holstein cows were chosen and divided into 2 groups (healthy group (317), sub-clinical and clinical group (100)) to investigate variation in bovine Tumor necrosis factor-alpha (TNF-) gene and ana- lyze their associations with mastitis. By PCR-RFLP and CRS-RFLP analyses, three polymorphic sites were detected, with one G→A mutation at 39 bp in exon2 a