基因组育种值估计的贝叶斯方法的研究进展.pdfVIP

Hereditas (Beijing) 2014 年 2 月, 36(2): 111―118 综 述 基因组育种值估计的贝叶斯方法 1,2 2 2 3 2 王重龙 , 丁向东 , 刘剑锋 , 殷宗俊 , 张勤 1. 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所, 合肥 230031 ; 2. 中国农业大学动物科技学院, 北京 100193; 3. 安徽农业大学动物科技学院, 合肥 230036 摘要 : 基因组育种值估计是基因组选择的重要环节, 基因组育种值的准确性是基因组选择成功应用的关键, 而 其准确性在很大程度上取决于估计方法。目前研究和应用最多的基因组育种值估计方法是贝叶斯(Bayes)和最佳 线性无偏预测(BLUP) 两大类方法。文章系统介绍了目前已提出的各种Bayes 方法, 并总结了该类方法的估计效 果和各方面的改进。模拟数据和实际数据研究结果都表明, Bayes 类方法估计基因组育种值的准确性优于BLUP 类方法, 特别对于存在较大效应QTL 的性状其优势更明显。由于Bayes 方法的理论和计算过程相对复杂, 目前 其在实际育种中的运用不如 BLUP 类方法普遍, 但随着快速算法的开发和计算机硬件的改进, 计算问题有望得 到解决; 另外, 随着对基因组和性状遗传结构研究的深入开展, 能为 Bayes 方法提供更为准确的先验信息, 从 而使Bayes 方法估计基因组育种值准确性的优势更加突出, 应用将会更加广泛。 关键词 : 基因组选择; 基因组育种值; 贝叶斯方法 Bayesian methods for genomic breeding value estimation 1,2 2 2 3 2 Chonglong Wang , Xiangdong Ding , Jianfeng Liu , Zongj un Yin , Qin Zhang 1. Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Anhui Academy of Agricultural Sciences , Hefei 230031, China; 2. College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China; 3. College of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University , Hefei 230036, China Abstract: Estimation of genomic breeding values is the key step in genomic selection. The successful application of genomic selection depends on the accuracy of genomic estimated breeding values, which is mostly determined by the estimation method. Bayes-type and BLUP-type methods are the two main methods which have been 收稿日期: 2013−06−