蠕虫线粒体基因组研究及其应用进展.pdfVIP

2011 年 第 56 卷 第 28-29 期：2358 ~ 2372 《中国科学》杂志社 评 述 SCIENCE CHINA PRESS 蠕虫线粒体基因组研究及其应用进展 贾万忠, 闫鸿斌, 倪兴维, 娄忠子, 李宏民, 曹平, 才学鹏 中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室, 甘肃省动物寄生虫病重点实验室, 农业部兽医公共卫生重点开放 实验室, 兰州 730046 E-mail: jwanzhong@ 2011-02-16 收稿, 2011-06-15 接受 公益性行业(农业)科研专项(200903036-07)、国家科技支撑计划(2007BAD40B04)和家畜疫病病原生物学国家重点实验室自主课题 (SKLVEB2008ZZKT014)资助项目 摘要 蠕虫主要包括扁形动物和线虫, 其种类繁多, 生活方式多样, 可寄生于动物和植物体内, 关键词 引起蠕虫病, 其中血吸虫病、棘球蚴病、旋毛虫病等是重要的人兽共患寄生虫病, 在世界各地 蠕虫 普遍流行, 危害严重. 蠕虫线粒体基因组的碱基组成、基因结构、基因变异等方面有其特点, 这 线粒体基因组 为蠕虫线粒体功能基因组学研究、比较基因组学研究、分子分类学研究、虫种(株)鉴定与分类、 进化 分子分类 生态学研究、分子系统发育和进化分析等提供了重要依据, 为蠕虫病的诊断、分子流行病学与 DNA 条形码 生态学调查等分子检测方法的建立奠定了基础. 近 20 年来蠕虫线粒体基因组研究得到了极大 发展, 迄今为止, 已完成蠕虫93 个种(虫株)线粒体基因组全序列测定和分析. 本文将对蠕虫线 粒体基因组序列分析方面的研究进展、应用和今后发展方向作一简要评述. 蠕虫(helminths)隶属于动物界, 主要包括扁形动 突变率高, 进化速度快. 此外, 线粒体基因的碱基组 物门(Platyhelminthes)、线形动物门(Nematoda)和棘头 成, 基因的排列位置, 遗传密码的使用, tRNA 的二级 动物门(Acanthocephala), 是生物界中重要的一大类 结构, 主要非编码区数目、位置及其二级结构等有其 生物, 多数营寄生生活, 既可寄生于家畜、家禽及人 自身特点, 为人们研究真核生物的起源和线粒体基 体内, 也可寄生于植物体内, 导致动物(包括人)和植 因的演化、物种种群遗传学特性、物种分类等提供了 物的疾病, 危害严重[1~4]. 深入了解蠕虫种群遗传学 便利条件. 线粒体基因组的这些特征已经在蠕虫的 特性, 不仅有助于研究蠕虫的系统分类学、起源、进 分类、种群遗传学分析、基因进化、物种起源、疾病 化等, 而且有助于开展蠕虫病流行病学和生态学等 诊断等方面得到了越来越多的应用[9,10]. 为此, 本文 研究, 从而为蠕虫病的有效防控提供重要依据和指 针对蠕虫线粒体基因组的研究进展及其应用作一 导作用[5~8]. 虽然 18S 核糖体rRNA 基因(18S rDNA) 评述. 和内部转录间隔(ITS1 和ITS2) 被证明是鉴定蠕虫可 靠的分子遗传标记, 但是用线粒体基因来代替 18S 1 蠕虫线粒体基因组全序列测定完成概况 rDNA 和ITS 作为分子遗传标记, 用于分析和鉴定蠕 自1990 年, 猪蛔虫(Ascaris suum Goeze, 1982)和 虫种类尤其是亲缘关系相近种或者虫株、研究基因的 秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans Maupas, 1900) 变异现象等则更为有效. 动物线粒体基因组很小, 独 线粒体基因组