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- 2016-03-24 发布于贵州
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河北省人感染汉病毒M片段基因特征研究
中文摘要
河北省人感染汉坦病毒M片段基因特征研究
摘 要
目的:探讨河北省肾综合征出血热患者血清中汉坦病毒
的基因型别,分析人感染汉坦病毒基因型的分布和变异情
况,为预防和控制肾综合征出血热在河北省的流行提供科学
依据。
方法:
1通过流行病学调查,收集病人或疑似病人急性期血清
标本;
2采用间接免疫荧光法筛选阳性标本,从中提取汉坦病
毒RNA;
3通过RT-nestedPCR扩增病毒核酸,进行基因分型;
4选择代表性疫区血清标本PCR扩增产物经纯化回收
后进行序列测定,根据G1和G2片段基因序列分别用
DNASTAR软件进行同源序列比较并构建系统发生树,对河
北省人感染汉坦病毒的基因亚型分布、核苷酸变异及特征进
行分析。
结果:
1 2006年河北省共报告肾综合征出血热病例1060例,
发病率为1.55/10万,疫区在全省广泛存在,“个地市均有
发病。主要集中在河北省东北部的唐山、秦皇岛,占全省发
病总数的63,77%;其次为河北省中部和南部的保定、石家
庄、邢台、沧州、衡水;张家口、承德、邯郸、廊坊发病较
低。体现了HFRS高度散发又相对集中的区域特征。
中文摘要
22006年共收集病人或疑似病人血清标本152份,经间
接免疫荧光法(IFA)检测阳性94份,阳性率为61.84%。
份阳性结果,阳性率为24.64%,其中≤7天的标本35份,
0份。
4对河北省汉坦病毒阳性病人血清标本同时用SEO型
和HTN型分型引物进行RT-nestedPCR扩增,显示17份阳性
标本所携带汉坦病毒均为SEO型,未发现HTN型。
5选取有代表性的11份标本进行序列测定,分析表明
其同源性较高,核苷酸变异既有转换也有颠换。汉坦病毒
染汉坦病毒基因变异不大,同型之间M片段的基因序列相对
比较保守。
O、ZTl
等亲缘关系较近外,其余均与SDI 0等的关系较近,
中文摘要
同属于S3亚型。系统进化树分析未发现HTN型汉坦病毒的
存在,此与核苷酸同源性比较的结果一致。
7基因分型及系统进化树分析表明,河北省是典型的
个亚型,分型结果一致,均以s3亚型为主。在地理位置相
近的地区,病毒基因组核苷酸序列同源性相对较高,系统进
化关系较近。这说明河北省人感染汉坦病毒的分布具有一定
的地理区域性。
结论:
l用RT-PCR技术直接扩增病人早期血中汉坦病毒是可
行的,可用于早期快速诊断,但需进~步完善,提高检出率。
2从血清标本直接提取汉坦病毒RNA存在一定难度,
但急性期血清相对易于提取,随着发病时间的延长提取率下
降。
3河北省人感染汉坦病毒以SEO型为主,共包括Sl、
S3两个亚型,以S3亚型为主。G1和G2片段分型结果一致,
未发现新亚型。
4河北省人感染汉坦病毒基因变异不大,同型之间M片
段序列相对较保守。
5在地理位置相近的地区,病毒基因组核苷酸序列同源
性相对较高,系统进化关系较近,汉坦病毒的分布具有一定
的地理区域性。
关键词:汉坦病毒;基因型;RT-nestedPCR;M片段:
系统进化树
——薹查塑墨
ofthe
AnalysisGene
Characteristicof
HantavjrusM
segmentHFRS
Patientsin
among Hebei
Province
ABSTRACT
objective:Tothe
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